RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LDB2O43679 373 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RECKO95980 971 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NTRK1P04629 796 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MC4RP32245 332 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASRP41180 1078 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TUBB4BP68371 445 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TUBB2AQ13885 445 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMTC4Q5T4D3 741 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC13Q8NBP0 860 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TUBB2BQ9BVA1 445 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMFRQ9UKV5 643 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKAA1Q13131 559 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARP6Q2NL67 630 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PEX26Q7Z412 305 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1328Q86T90 577 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4E2Q8NGC2 313 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOHLH2Q9NX45 425 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FLNCQ14315 2725 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MKRN2OSH3BPM6 223 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR19Q15760 415 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCTD11Q693B1 232 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM135Q86UB9 458 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBL4BQ8N7F7 174 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM71DQ8N9W8 422 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACVR1CQ8NER5 493 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR8K5Q8NH50 307 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FERD3LQ96RJ6 166 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR87Q9BY21 358 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACTL8Q9H568 366 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COG4Q9H9E3 785 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS37BQ9H9H4 285 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCND1Q9NSA2 647 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCRG1O75711 98 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINA9Q86WD7 417 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM126BQ8IUX1 230 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCN9Q8WX39 176 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEC14L1Q92503 715 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPM1MQ96MI6 270 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBSNQ9H1K0 784 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRMSQ9H3Y6 488 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC40Q9H9A6 602 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POMT2Q9UKY4 750 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTRCQ9Y297 605 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H7C0S8 307 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MATN2O00339 956 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFPL1O75677 317 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL18O95568 372 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPH1P17752 444 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDH3P22223 829 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACRV1P26436 265 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS15P62841 145 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF449Q6P9G9 518 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAS2R42Q7RTR8 314 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYCE1Q8N0S2 351 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RUFY1Q96T51 708 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR52A5Q9H2C5 316 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPN4P29074 926 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PMS2P54278 862 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POU6F1Q14863 301 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FANCEQ9HB96 536 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LATS2Q9NRM7 1088 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1GALT1Q9NS00 363 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSAPA4D1B5 854 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRSS56P0CW18 603 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD151P48509 253 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF5AQ12840 1032 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLRB1Q12918 225 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 P3H1Q32P28 736 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCTN3Q6NUS6 607 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MICALCLQ6ZW33 695 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN19Q8N6F1 224 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STYXQ8WUJ0 223 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MR1Q95460 341 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLR10Q9BXR5 811 aa25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms