RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 C12orf66Q96MD2 445 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 P2RY12Q9H244 342 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 PDP2Q9P2J9 529 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 BANF1O75531 89 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 DXOO77932 396 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 FTH1P02794 183 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 THRAP10827 490 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 MAPK9P45984 424 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 PREPP48147 710 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 C2orf54Q08AI8 447 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 RPA4Q13156 261 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 C16orf72Q14CZ0 275 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 MORF4L2Q15014 288 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 TYSND1Q2T9J0 566 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 PHF19Q5T6S3 580 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 NAPRTQ6XQN6 538 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 RAB11FIP2Q7L804 512 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 PROSER1Q86XN7 944 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 NCSTNQ92542 709 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 CCDC74BQ96LY2 380 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 PWWP2AQ96N64 755 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 DPYSL5Q9BPU6 564 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 TRIM31Q9BZY9 425 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 STRADBQ9C0K7 418 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 EPB41L1Q9H4G0 881 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 UNC13CQ8NB66 2214 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 ZZEF1O43149 2961 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 SLC5A10A0PJK1 596 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 IQCF5A8MTL0 148 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 EFCAB8A8MWE9 144 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 AGRPO00253 132 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 PLD2O14939 933 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 USP1O94782 785 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 UBXN7O94888 489 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 HGFP14210 728 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 TYRP1P17643 537 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 PAMP19021 973 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 CCR7P32248 378 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 ITGA8P53708 1063 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 BRD3Q15059 726 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 MRNIPQ6NTE8 343 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 NEPROQ6NW34 567 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 FOXR1Q6PIV2 292 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 IGF2-ASQ6U949 168 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 RCBTB1Q8NDN9 531 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 ELMO1Q92556 727 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 SNF8Q96H20 258 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 SLC46A1Q96NT5 459 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 CARD6Q9BX69 1037 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 ASCL3Q9NQ33 180 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 LOXL2Q9Y4K0 774 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 USP24Q9UPU5 2620 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 FAM187AA6NFU0 413 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 RAD51CO43502 376 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 NDUFS3O75489 264 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 ITGB6P18564 788 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 OGNP20774 298 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.052e-57■■□□□ 12.4
ACTB-206ENST00000443528 RPL21P46778 160 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 CD151P48509 253 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 BBS9Q3SYG4 887 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 ZNF789Q5FWF6 425 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 CENPUQ71F23 418 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 CILP2Q8IUL8 1156 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 IGDCC3Q8IVU1 814 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 LSMEM2Q8N112 164 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 KRT222Q8N1A0 295 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 FBXO39Q8N4B4 442 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 OTUD6BQ8N6M0 293 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 ZFPM2Q8WW38 1151 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 LPGAT1Q92604 370 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 RSC1A1Q92681 617 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 BIRC8Q96P09 236 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 TCF12Q99081 682 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
ACTB-206ENST00000443528 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
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