RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368215.7

PTPRK-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-206ENST00000368215 ASF1AQ9Y294 204 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 K7EPI3 171 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 KPNA5O15131 536 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 INPPL1O15357 1258 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 SLC26A3P40879 764 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 STK19P49842 368 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 CASP9P55211 416 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 TRIM16LQ309B1 348 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM199Q8N511 208 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 ATL1Q8WXF7 558 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 AP2M1Q96CW1 435 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 KNL1Q8NG31 2342 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 LOC730098B7Z3J9 87 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 TRBC1P01850 177 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 EPORP19235 508 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 ADARP55265 1226 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 FOXA1P55317 472 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 CYP4F2P78329 520 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 BROXQ5VW32 411 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 TPGS2Q68CL5 300 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 SYVN1Q86TM6 617 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 TBC1D19Q8N5T2 526 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 IGSF21Q96ID5 467 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 PHF12Q96QT6 1004 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 C1orf109Q9NX04 203 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 PRORSD1PA6NEY8 169 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 MAN1A2O60476 641 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 DDX5P17844 614 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 S100A5P33763 92 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 WASP42768 502 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 PRKAG1P54619 331 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 NFKB2Q00653 900 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 PTPRRQ15256 657 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 TLR1Q15399 786 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 MAPK11Q15759 364 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 AADATQ8N5Z0 425 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 OR2AP1Q8NGE2 309 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 OR13J1Q8NGT2 312 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 ACDQ96AP0 544 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 APOL4Q9BPW4 351 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 MEAF6Q9HAF1 191 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 CREBZFQ9NS37 354 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 TREX1Q9NSU2 369 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 DUSP12Q9UNI6 340 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 A0A1W2PP18 115 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 ADAM12O43184 909 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 TLL1O43897 1013 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 GSTM1P09488 218 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 COL6A1P12109 1028 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 FDXRP22570 491 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 RGRP47804 291 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 RPS14P62263 151 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 PRKCQQ04759 706 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 STX19Q8N4C7 294 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 CGREF1Q99674 301 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 TCF25Q9BQ70 676 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 LRRC3Q9BY71 257 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 RASSF1Q9NS23 344 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 INSL5Q9Y5Q6 135 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 H3BM21 787 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 I6L893 689 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 LDB2O43679 373 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 H6PDO95479 791 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 THRBP10828 461 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 RRM2P31350 389 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 SLC6A4P31645 630 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 PTGR1Q14914 329 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 PIGGQ5H8A4 983 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 C6orf136Q5SQH8 315 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 LRRC66Q68CR7 880 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 HID1Q8IV36 788 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 CFAP206Q8IYR0 622 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 SETD9Q8NE22 299 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-206ENST00000368215 RANBP9Q96S59 729 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.7 ms