RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516658.1

RNU6-347P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 347, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-347P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-347P-201ENST00000516658 OTX2P32243 289 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 SHMT1P34896 483 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 RFC4P35249 363 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 GMPRP36959 345 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 CD97P48960 835 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 NUMBP49757 651 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 CLCN5P51795 746 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 COPB1P53618 953 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 PTENP60484 403 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 CXADRP78310 365 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 GCNT1Q02742 428 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 CFHR3Q02985 330 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 MECOMQ03112 1051 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 OCA2Q04671 838 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 GAD2Q05329 585 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 PLD1Q13393 1074 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 GALNT3Q14435 633 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 MSMPQ1L6U9 139 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 SLC36A3Q495N2 470 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 RABL3Q5HYI8 236 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 PRR31Q5SQ13 230 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 ARMC6Q6NXE6 501 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 TEX38Q6PEX7 206 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 Q6ZNB5 142 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 MAVSQ7Z434 540 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 MDGA2Q7Z553 956 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 DTX1Q86Y01 620 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF679Q8IYX0 411 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 CADM3Q8N126 398 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 Q8NA96 180 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 GJC3Q8NFK1 279 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 BEST2Q8NFU1 509 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 ELP5Q8TE02 316 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 CKAP2Q8WWK9 683 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 OIT3Q8WWZ8 545 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 CAVIN3Q969G5 261 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 FBXO32Q969P5 355 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 LENG9Q96B70 501 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 DTD2Q96FN9 168 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 BOD1Q96IK1 185 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 PANX3Q96QZ0 392 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPATA25Q9BR10 227 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 CCSER1Q9C0I3 900 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 THAP2Q9H0W7 228 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMEM245Q9H330 911 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 CUEDC2Q9H467 287 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 RAD21L1Q9H4I0 556 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 GPR108Q9NPR9 543 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 MTMR10Q9NXD2 777 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 GDAP2Q9NXN4 497 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 KCNJ14Q9UNX9 436 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 MGAT4BQ9UQ53 548 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 NCAPD2Q15021 1401 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 MACROD2A1Z1Q3 448 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 MAGEA13PA6NCF6 341 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 TRIM49BA6NDI0 452 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 CAPN14A8MX76 684 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 LACTBL1A8MY62 500 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 TLR4O00206 839 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 SOCS6O14544 535 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 CXCL11O14625 94 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 MAP2K7O14733 419 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 NDUFS4O43181 175 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPOPO43791 374 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 B4GALT4O60513 344 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 FCGR3BO75015 233 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 ATG13O75143 517 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 NFATC1O95644 943 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 ATP6V1C1P21283 382 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 CD151P48509 253 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 SLC9A3P48764 834 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 CLCNKBP51801 687 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 CDR1P51861 262 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 PRRX1P54821 245 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 ACTR3P61158 418 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 SSTP61278 116 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 CDK3Q00526 305 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-347P-201ENST00000516658 FOLH1Q04609 750 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms