RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376350.7

PTPRH-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,877 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-202ENST00000376350 EGFL7Q9UHF1 273 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 E7ENX8 843 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 MMP2P08253 660 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 POU4F1Q01851 419 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 TSNQ15631 228 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 MTX3Q5HYI7 312 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 DSG4Q86SJ6 1040 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 ZNF683Q8IZ20 524 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 TRPC4APQ8TEL6 797 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 LHX3Q9UBR4 397 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 VTI1BQ9UEU0 232 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 NEU3Q9UQ49 428 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 LDB2O43679 373 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 CDK14O94921 469 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 PCCBP05166 539 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 SPAM1P38567 509 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 DPP6P42658 865 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 PGAM4Q8N0Y7 254 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 FBXO39Q8N4B4 442 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 HDDC3Q8N4P3 179 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 DEFB119Q8N690 84 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 HMGB4Q8WW32 186 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 ASB16Q96NS5 453 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 PCDH12Q9NPG4 1184 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 DZANK1Q9NVP4 752 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 PRRT4C9JH25 899 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 UBXN8O00124 270 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 MRASO14807 208 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 FAM58BPP0C7Q3 252 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 UBXN2BQ14CS0 331 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 PON2Q15165 354 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 VITQ6UXI7 678 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 CUZD1Q86UP6 607 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 OR13J1Q8NGT2 312 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 RSPRY1Q96DX4 576 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 MED8Q96G25 268 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 TMEM79Q9BSE2 394 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 ZBTB26Q9HCK0 441 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 AP4S1Q9Y587 144 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 TTC28Q96AY4 2481 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 FAM149AA5PLN7 773 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 C16orf96A6NNT2 1141 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 TIPRLO75663 272 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 PEX11BO96011 259 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 CKMT2P17540 419 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 PXNP49023 591 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 ADGRE1Q14246 886 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 IHHQ14623 411 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 NADK2Q4G0N4 442 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 ARMC3Q5W041 872 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 SLC45A3Q96JT2 553 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 OLFM1Q99784 485 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 SLC6A17Q9H1V8 727 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 MID1IP1Q9NPA3 183 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 UBAP1Q9NZ09 502 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 GJA4P35212 333 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 GRIA3P42263 894 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 SLC7A2P52569 658 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 STX5Q13190 355 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 FAM45BPQ6NSW5 357 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 ADCK2Q7Z695 626 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 FAM45AQ8TCE6 357 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 LPGAT1Q92604 370 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 TRIM54Q9BYV2 358 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 MAFFQ9ULX9 164 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 A0A0J9YYE9 177 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 SLCO1B7G3V0H7 640 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 TRBC1P01850 177 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 ZNF423Q2M1K9 1284 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 LILRA2Q8N149 483 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 PFDN4Q9NQP4 134 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 INVSQ9Y283 1065 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRH-202ENST00000376350 A0A1W2PP55 124 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRH-202ENST00000376350 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms