RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 TCAF1Q9Y4C2 921 aa30.05■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa30.05■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP30.04■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 VPS41P49754 854 aa30.04■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 GPR18Q14330 331 aa30.04■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 TTC27Q6P3X3 843 aa30.04■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 GPR150Q8NGU9 434 aa30.04■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 HM13Q8TCT9 377 aa30.04■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 HDAC10Q969S8 669 aa30.04■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP30.04■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 WWP1Q9H0M0 922 aa30.04■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 RIMKLBQ9ULI2 386 aa30.04■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 USP27XA6NNY8 438 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 A8MU76 341 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 UBXN7O94888 489 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 CCL4P13236 92 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 TYRP1P17643 537 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 AMD1P17707 334 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 FOXN2P32314 431 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 TERF1P54274 439 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 AFTPHQ6ULP2 937 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 NLRP9Q7RTR0 991 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 AGBL5Q8NDL9 886 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 ZNF778Q96MU6 729 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 OGFRQ9NZT2 677 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 PDP2Q9P2J9 529 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 KLHL3Q9UH77 587 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 ACSL5Q9ULC5 683 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 SNX12Q9UMY4 172 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 GOT2P00505 430 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 KRT14P02533 472 aa30.02■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 SLC35G4P0C7Q5 338 aa30.02■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 CFAP206Q8IYR0 622 aa30.02■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 USP7Q93009 1102 aa30.02■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 CRELD1Q96HD1 420 aa30.02■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 VPS37BQ9H9H4 285 aa30.02■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa30.01■■■□□ 2.4
INO80B-201ENST00000233331 PRAMEF10O60809 474 aa30.01■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 POLBP06746 335 aa30.01■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 TPSB2P20231 275 aa30.01■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 TLE3Q04726 772 aa30.01■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 GPS1Q13098 491 aa30.01■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 ITIH4Q14624 930 aa30.01■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 TPSAB1Q15661 275 aa30.01■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 PCID2Q5JVF3 399 aa30.01■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 XKR5Q6UX68 686 aa30.01■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 PLXDC1Q8IUK5 500 aa30.01■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 CLDN19Q8N6F1 224 aa30.01■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 ACTRT1Q8TDG2 376 aa30.01■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 C12orf66Q96MD2 445 aa30.01■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 AP3B1O00203 1094 aa30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 NVLO15381 856 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 KLK10O43240 276 aa30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 COILP38432 576 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 GFERP55789 205 aa30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 PRAMEP78395 509 aa30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 CRADDP78560 199 aa30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 ACVR1Q04771 509 aa30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 CYP1B1Q16678 543 aa30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 OR6P1Q8NGX9 317 aa30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 RSC1A1Q92681 617 aa30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 RMDN2Q96LZ7 410 aa30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 CCM2Q9BSQ5 444 aa30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 BFARQ9NZS9 450 aa30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 ZFHX4Q86UP3 3567 aa29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 NSG1P42857 185 aa29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 CAPZBP47756 277 aa29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 FAM129CQ86XR2 697 aa29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 PEX13Q92968 403 aa29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 DPH1Q9BZG8 443 aa29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 IL22Q9GZX6 179 aa29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 COG4Q9H9E3 785 aa29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 CHRAC1Q9NRG0 131 aa29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 FOXJ2Q9P0K8 574 aa29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 PYCARDQ9ULZ3 195 aa29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 PRSS21Q9Y6M0 314 aa29.99■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa29.98■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa29.98■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 EFCAB7A8K855 629 aa29.98■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 C9orf172C9J069 976 aa29.98■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 CES2O00748 559 aa29.98■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 ZNF185O15231 689 aa29.98■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 PHF2O75151 1096 aa29.98■■■□□ 2.39
INO80B-201ENST00000233331 AP2A2O94973 939 aa29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms