RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.4□□□□□ -1.38
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SBNO1-202ENST00000420886 TMBIM1Q969X1 311 aa6.4□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.4□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF69Q9UC07 566 aa6.4□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PTPRUQ92729 1446 aa6.4□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 NUP98P52948 1817 aa6.4□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SMIM18P0DKX4 95 aa6.4□□□□□ -1.38
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SBNO1-202ENST00000420886 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
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SBNO1-202ENST00000420886 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.4□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.4□□□□□ -1.38
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SBNO1-202ENST00000420886 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 MON1BQ7L1V2 547 aa6.39□□□□□ -1.39
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SBNO1-202ENST00000420886 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 KAZALD1Q96I82 304 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 IFT46Q9NQC8 304 aa6.39□□□□□ -1.39
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