RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641145.1

NFIC-211, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

BASIC

Gene NFIC, Length 8,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-211ENST00000641145 MADCAM1Q13477 382 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 SLC8B1Q6J4K2 584 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 THAP6Q8TBB0 222 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 NDNQ99608 321 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 IL12RB2Q99665 862 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 ETAA1Q9NY74 926 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 NR2E1Q9Y466 385 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 SLC35G6P0C7Q6 338 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 ANTXR2P58335 489 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 PDK3Q15120 406 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 PARP6Q2NL67 630 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 HHIPL2Q6UWX4 724 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 POU2F3Q9UKI9 436 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 CCRL2O00421 344 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 CCNE2O96020 404 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 AQP1P29972 269 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 SSTR1P30872 391 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 PSMD8P48556 350 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 GRIK2Q13002 908 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 METTL7BQ6UX53 244 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 ZMIZ2Q8NF64 920 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 ZNF649Q9BS31 505 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 ITGB1P05556 798 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 NR1H2P55055 460 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 EIPR1Q53HC9 387 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 ZER1Q7Z7L7 766 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 DPEP2Q9H4A9 486 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa16.08■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 CTPS1P17812 591 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 TLE2Q04725 743 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 IDNKQ5T6J7 187 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 OXR1Q8N573 874 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 TMIEQ8NEW7 156 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 TMEM125Q96AQ2 219 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 WFS1O76024 890 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 AGXTP21549 392 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 PSMB4P28070 264 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 SLC30A10Q6XR72 485 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 STOML3Q8TAV4 291 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 MND1Q9BWT6 205 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 FAM83DQ9H4H8 585 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 USP20Q9Y2K6 914 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 LOC100509620A0A075B734 347 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 OAZ2O95190 189 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 ZNF311Q5JNZ3 666 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 IRF2P14316 349 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 SP3Q02447 781 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 BNIP3Q12983 259 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 DNM1P34Q6PK57 102 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 IFNL1Q8IU54 200 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 COX18Q8N8Q8 333 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 OR51V1Q9H2C8 321 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 TBC1D17Q9HA65 648 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 DHX15O43143 795 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 TMEM145Q8NBT3 493 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 OR14C36Q8NHC7 312 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 CD300LFQ8TDQ1 290 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 OR12D3Q9UGF7 316 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 BCKDKO14874 412 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 ADAMTS3O15072 1205 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 IPO13O94829 963 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 PSKH1P11801 424 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 AKR1A1P14550 325 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 GNB3P16520 340 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 TFEBP19484 476 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 GRK1Q15835 563 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 ZNF410Q86VK4 478 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 UFD1Q92890 307 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 UROC1Q96N76 676 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 NFASCO94856 1347 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 TBX1O43435 398 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 USP12O75317 370 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 SLC22A3O75751 556 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 Q4G0T1 1027 aa16.07■□□□□ 0.16
NFIC-211ENST00000641145 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms