RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BLOC1S6Q9UL45 172 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNX7Q9UNH6 387 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF114Q9Y508 228 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SYCE3A1L190 88 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 F8W810 466 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MGST3O14880 152 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TOMM70O94826 608 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MMP3P08254 477 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRT4P19013 534 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NR2F2P24468 414 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHATP28329 748 aa4.89□□□□□ -1.63
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 NAGLUP54802 743 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HFEQ30201 348 aa4.89□□□□□ -1.63
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 GGNBP1Q5YKI7 109 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GALNT17Q6IS24 598 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MTSS1LQ765P7 747 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRILQ7L0X0 811 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RABEPKQ7Z6M1 372 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C1QL4Q86Z23 238 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SFTPA2Q8IWL1 248 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UXS1Q8NBZ7 420 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AGBL3Q8NEM8 1001 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DBF4BQ8NFT6 615 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CAGE1Q8TC20 777 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAP4K1Q92918 833 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EME1Q96AY2 570 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM18Q96B42 140 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COQ10AQ96MF6 247 aa4.89□□□□□ -1.63
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM206Q9H813 350 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPAG4Q9NPE6 437 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF146Q9NTX7 359 aa4.89□□□□□ -1.63
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITGA11Q9UKX5 1188 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZBTB43O43298 467 aa4.88□□□□□ -1.63
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 MOSPD3O75425 235 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 REC8O95072 547 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MOCS3O95396 460 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GUCA1CO95843 209 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EGFP01133 1207 aa4.88□□□□□ -1.63
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GNAZP19086 355 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SOAT1P35610 550 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PIGAP37287 484 aa4.88□□□□□ -1.63
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNU13P55769 128 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ST8SIA6P61647 398 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARF5P84085 180 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRIK2Q13002 908 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TUBA3CQ13748 450 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NEDD9Q14511 834 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MEP1AQ16819 746 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM71Q6P5X7 295 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TUBA3EQ6PEY2 450 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF207Q6ZRF8 634 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TIGD4Q8IY51 512 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR7G3Q8NG95 312 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OCC1Q8TAD7 63 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARRDC2Q8TBH0 407 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBC1D16Q8TBP0 767 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPT2Q8TD30 523 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HEXDCQ8WVB3 486 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNASE1L2Q92874 299 aa4.88□□□□□ -1.63
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