RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 ZNF547Q8IVP9 402 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 NAGSQ8N159 534 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 DNAAF3Q8N9W5 541 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 DDHD1Q8NEL9 900 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 GDAP1Q8TB36 358 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 NAT6Q93015 286 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 SMOXQ9NWM0 555 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 SLC23A2Q9UGH3 650 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 RABGEF1Q9UJ41 708 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 APPL1Q9UKG1 709 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 NEU2Q9Y3R4 380 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 H7C0S8 307 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 PHF2O75151 1096 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 EML2O95834 649 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 KRT14P02533 472 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 ACP5P13686 325 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 PSMA3P25788 255 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 HADHAP40939 763 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 MAZP56270 477 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
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ACTB-206ENST00000443528 C14orf28Q4W4Y0 310 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 CCDC38Q502W7 563 aa15.52■□□□□ 0.08
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ACTB-206ENST00000443528 PATE1Q8WXA2 126 aa15.52■□□□□ 0.08
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ACTB-206ENST00000443528 CCDC74AQ96AQ1 378 aa15.52■□□□□ 0.08
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ACTB-206ENST00000443528 ASB8Q9H765 288 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 KCNK6Q9Y257 313 aa15.52■□□□□ 0.08
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ACTB-206ENST00000443528 FRYQ5TBA9 3013 aa15.52■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 MYLKQ15746 1914 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 CCDC78A2IDD5 438 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 KMOO15229 486 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 ECEL1O95672 775 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 GLB1P16278 677 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 CAMK2BQ13554 666 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 C11orf96Q7Z7L8 435 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 LRRTM4Q86VH4 590 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 CREG2Q8IUH2 290 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 ARL14Q8N4G2 192 aa15.51■□□□□ 0.07
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ACTB-206ENST00000443528 OR6C4Q8NGE1 309 aa15.51■□□□□ 0.07
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ACTB-206ENST00000443528 TBC1D29Q9UFV1 150 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 RNF215Q9Y6U7 377 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 CTAGE9A4FU28 777 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 A6NCN8 305 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 PRR19A6NJB7 356 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 MT-CO3P00414 261 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 JUPP14923 745 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 MC4RP32245 332 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 FNTAP49354 379 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 VPS41P49754 854 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 ARSDP51689 593 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 CLCNKAP51800 687 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 CTSCP53634 463 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 GPS1Q13098 491 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZNF534Q76KX8 674 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 SNX20Q7Z614 316 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 CAPZA3Q96KX2 299 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZNF778Q96MU6 729 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 TTC25Q96NG3 672 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 ABCG4Q9H172 646 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 KLC4Q9NSK0 619 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 LRIT1Q9P2V4 623 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 SAR1BQ9Y6B6 198 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 HEATR9A2RTY3 570 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 GAS8O95995 478 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-206ENST00000443528 C1QTNF9P0C862 333 aa15.49■□□□□ 0.07
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