RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 CYP3A43Q9HB55 503 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 OXSMQ9NWU1 459 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 COL18A1P39060 1754 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ANGPTL1O95841 491 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 HMGCRP04035 888 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 LCKP06239 509 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 CYP2C8P10632 490 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 CYP3A7P24462 503 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 GP5P40197 560 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 CENPAP49450 140 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 PLK1P53350 603 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 KCNAB2Q13303 367 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 NOMO1Q15155 1222 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 RPS6KA2Q15349 733 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 LIPMQ5VYY2 423 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 SPESP1Q6UW49 350 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 BBS7Q8IWZ6 715 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 TIGD4Q8IY51 512 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 AMER2Q8N7J2 671 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 PLD5Q8N7P1 536 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ANKRD52Q8NB46 1076 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 STON2Q8WXE9 905 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 AGAP2Q99490 1192 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 GIMAP2Q9UG22 337 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 SCML1Q9UN30 329 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 MT-ND2P03891 347 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 UBE3AQ05086 875 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 INCA1Q0VD86 236 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 IRF5Q13568 498 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 SQLEQ14534 574 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 PARP15Q460N3 678 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 FSTL4Q6MZW2 842 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 GALNT5Q7Z7M9 940 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 RETREG3Q86VR2 466 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 RNF135Q8IUD6 432 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF540Q8NDQ6 660 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ACVR1CQ8NER5 493 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 OR4M2Q8NGB6 313 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 FAM118AQ9NWS6 357 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 NPAP1Q9NZP6 1156 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 MAST2Q6P0Q8 1798 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 DOCK2Q92608 1830 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 DLEC1Q9Y238 1755 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 NEMP2A6NFY4 417 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 MEIS2O14770 477 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 OGTO15294 1046 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 GRAP2O75791 330 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ERP29P30040 261 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 HNF4AP41235 474 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ALDH3A2P51648 485 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ACOX1Q15067 660 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 RAB6CQ53S08 254 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 PJA1Q8NG27 643 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ZFAND1Q8TCF1 268 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 PTERQ96BW5 349 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 Q96MT0 163 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 RAB6CQ9H0N0 254 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 SDCBP2Q9H190 292 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 VPS33BQ9H267 617 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF556Q9HAH1 456 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 TLR9Q9NR96 1032 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ASNSD1Q9NWL6 643 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 CLRN2A0PK11 232 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 KPNA6O60684 536 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 ATG13O75143 517 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-203ENST00000395211 SLURP2P0DP57 97 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms