RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 SMIM14Q96QK8 99 aa18.17■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa18.17■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 TRABDQ9H4I3 376 aa18.17■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 PTPRBP23467 1997 aa18.17■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD36A6QL64 1941 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 RFPL3O75679 317 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 CAPNS1P04632 268 aa18.16■□□□□ 0.5
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PTX4-201ENST00000293922 CKMT2P17540 419 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 CTPS1P17812 591 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 ADRA1DP25100 572 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 NFKBIAP25963 317 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 HNF1BP35680 557 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 RALGDSQ12967 914 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 IRF4Q15306 451 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 CCNJLQ8IV13 435 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 GALNT15Q8N3T1 639 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 FBXO36Q8NEA4 188 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 PYROXD1Q8WU10 500 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 KIFC1Q9BW19 673 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 SOX13Q9UN79 622 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 CHMP2BQ9UQN3 213 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 TCAF1Q9Y4C2 921 aa18.16■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 HEATR9A2RTY3 570 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 SCAMP1O15126 338 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 FFAR2O15552 330 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 ALPIP09923 528 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 PIRTP0C851 137 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 YPEL5P62699 121 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 LAMB3Q13751 1172 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 LRRC14Q15048 493 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 AGERQ15109 404 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 CDKN3Q16667 212 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 WSCD2Q2TBF2 565 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
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PTX4-201ENST00000293922 CASC4Q6P4E1 433 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 TMEM135Q86UB9 458 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 ANKMY2Q8IV38 441 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 SAMD15Q9P1V8 674 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 ITPR1Q14643 2758 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 PKD1L2Q7Z442 2459 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa18.15■□□□□ 0.5
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PTX4-201ENST00000293922 MROH6A6NGR9 719 aa18.15■□□□□ 0.5
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PTX4-201ENST00000293922 LDB2O43679 373 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 CRTAMO95727 393 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 PGAM1P18669 254 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 THOP1P52888 689 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 PMS2P54278 862 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 PTPRRQ15256 657 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 NLRP9Q7RTR0 991 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 TTC30BQ8N4P2 665 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 C9orf72Q96LT7 481 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 TTC25Q96NG3 672 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 PLAC1Q9HBJ0 212 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 CHRAC1Q9NRG0 131 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 NLGN3Q9NZ94 848 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 NINJ2Q9NZG7 142 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 B4GALT6Q9UBX8 382 aa18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
PTX4-201ENST00000293922 RIMKLBQ9ULI2 386 aa18.15■□□□□ 0.5
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PTX4-201ENST00000293922 KRT37O76014 449 aa18.14■□□□□ 0.49
PTX4-201ENST00000293922 TTC4O95801 387 aa18.14■□□□□ 0.49
PTX4-201ENST00000293922 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
PTX4-201ENST00000293922 CDK4P11802 303 aa18.14■□□□□ 0.49
PTX4-201ENST00000293922 TSHRP16473 764 aa18.14■□□□□ 0.49
PTX4-201ENST00000293922 JUNDP17535 347 aa18.14■□□□□ 0.49
PTX4-201ENST00000293922 ACP1P24666 158 aa18.14■□□□□ 0.49
PTX4-201ENST00000293922 PSMA3P25788 255 aa18.14■□□□□ 0.49
PTX4-201ENST00000293922 CLDN6P56747 220 aa18.14■□□□□ 0.49
PTX4-201ENST00000293922 ILKQ13418 452 aa18.14■□□□□ 0.49
PTX4-201ENST00000293922 CAMK2BQ13554 666 aa18.14■□□□□ 0.49
PTX4-201ENST00000293922 PTK2BQ14289 1009 aa18.14■□□□□ 0.49
PTX4-201ENST00000293922 STEAP4Q687X5 459 aa18.14■□□□□ 0.49
PTX4-201ENST00000293922 LIPIQ6XZB0 460 aa18.14■□□□□ 0.49
PTX4-201ENST00000293922 MACC1Q6ZN28 852 aa18.14■□□□□ 0.49
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