RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PIK3C2BO00750 1634 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 RIMBP2O15034 1052 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 INMTO95050 263 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 POF1BQ8WVV4 589 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 RGS14O43566 566 aa6.44□□□□□ -1.38
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SBNO1-202ENST00000420886 NDST2P52849 883 aa6.44□□□□□ -1.38
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SBNO1-202ENST00000420886 GNA13Q14344 377 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 GLYATQ6IB77 296 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 OXR1Q8N573 874 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 IPMKQ8NFU5 416 aa6.44□□□□□ -1.38
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SBNO1-202ENST00000420886 VPS28Q9UK41 221 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 NAT2P11245 290 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CKMT2P17540 419 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 NDST1P52848 882 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 DCDC1P59894 354 aa6.44□□□□□ -1.38
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SBNO1-202ENST00000420886 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 NIM1KQ8IY84 436 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 FBXL20Q96IG2 436 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 DSN1Q9H410 356 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CYB561D2O14569 222 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SULT1C4O75897 302 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 WDPCPO95876 746 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PRG2P13727 222 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CYP24A1Q07973 514 aa6.43□□□□□ -1.38
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SBNO1-202ENST00000420886 NR2E1Q9Y466 385 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 A0A0A0MRY4 1105 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
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SBNO1-202ENST00000420886 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.43□□□□□ -1.38
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SBNO1-202ENST00000420886 BRD7Q9NPI1 651 aa6.43□□□□□ -1.38
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SBNO1-202ENST00000420886 DISC1C4P0D8 188 aa6.43□□□□□ -1.38
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SBNO1-202ENST00000420886 VMACQ2NL98 169 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 BBS12Q6ZW61 710 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SLC34A3Q8N130 599 aa6.43□□□□□ -1.38
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