RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592444.5

ERCC1-216, Transcript of ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunit, human

TSL 2

Gene ERCC1, Length 449 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC1-216	ENST00000592444	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SOCS6	O14544	535 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SLC19A2	O60779	497 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	HIP1R	O75146	1068 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RASGRP1	O95267	797 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	BMP7	P18075	431 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	UBA7	P41226	1012 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	STAT6	P42226	847 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PREP	P48147	710 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	VAV2	P52735	878 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	DCAF7	P61962	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	YPEL5	P62699	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RBPJ	Q06330	500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	DMTN	Q08495	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	NFIL3	Q16649	462 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MEMO1	Q9Y316	297 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MEGF11	A6BM72	1044 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RNF103	O00237	685 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CLDN4	O14493	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MCF2L	O15068	1137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	TACC1	O75410	805 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	BEST1	O76090	585 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MT-ND3	P03897	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CTSL	P07711	333 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ACPP	P15309	386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CES1	P23141	567 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	IL4R	P24394	825 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	IGFALS	P35858	605 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	NNMT	P40261	264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PRCP	P42785	496 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	GPR3	P46089	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	LIG4	P49917	911 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	NCKAP1L	P55160	1127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	TFF3	Q07654	80 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	KCNA1	Q09470	495 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	BIRC2	Q13490	618 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms