RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 IFT43Q96FT9 208 aa18.25■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 APOL2Q9BQE5 337 aa18.25■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 SUV39H2Q9H5I1 410 aa18.25■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 GPR27Q9NS67 375 aa18.25■□□□□ 0.51
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PTX4-201ENST00000293922 A6NNZ2 444 aa18.24■□□□□ 0.51
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PTX4-201ENST00000293922 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
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PTX4-201ENST00000293922 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 PDIK1LQ8N165 341 aa18.24■□□□□ 0.51
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PTX4-201ENST00000293922 ADGRE3Q9BY15 652 aa18.24■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 TSPYL1Q9H0U9 437 aa18.24■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 FTSJ1Q9UET6 329 aa18.24■□□□□ 0.51
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PTX4-201ENST00000293922 PROS1P07225 676 aa18.23■□□□□ 0.51
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PTX4-201ENST00000293922 SLC25A41Q8N5S1 370 aa18.22■□□□□ 0.51
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PTX4-201ENST00000293922 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
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PTX4-201ENST00000293922 DNAJC3Q13217 504 aa18.21■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 MTM1Q13496 603 aa18.21■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 FZD2Q14332 565 aa18.21■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 FAM153CQ494X1 144 aa18.21■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 TMEM52BQ4KMG9 183 aa18.21■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 TPRG1LQ5T0D9 272 aa18.21■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 ARMC3Q5W041 872 aa18.21■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 EMBQ6PCB8 327 aa18.21■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 RELL1Q8IUW5 271 aa18.21■□□□□ 0.51
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