RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 SPATA13Q96N96 652 aa14.65□□□□□ -0.06
TSTA3-208ENST00000528920 LYSMD1Q96S90 227 aa14.65□□□□□ -0.06
TSTA3-208ENST00000528920 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TSTA3-208ENST00000528920 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TSTA3-208ENST00000528920 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.65□□□□□ -0.06
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1B0GTQ1 180 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 F5H423 210 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 TOR1BO14657 336 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 LIASO43766 372 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 NDST3O95803 873 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 EPOP01588 193 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 FGGP02679 453 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 CD59P13987 128 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF30P17039 623 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 WNT3AP56704 352 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 YPEL5P62699 121 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 MPP3Q13368 585 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 MTM1Q13496 603 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 GALNT3Q14435 633 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 OASLQ15646 514 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 LRRC66Q68CR7 880 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 DENND2CQ68D51 928 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 OXR1Q8N573 874 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 DTD2Q96FN9 168 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 TM7SF3Q9NS93 570 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 USP24Q9UPU5 2620 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 A0A0U1RQS6 177 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 GCATO75600 419 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 ANXA9O76027 345 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 PSMB4P28070 264 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 ETV3P41162 512 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 RXRGP48443 463 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 CCT8P50990 548 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 STC1P52823 247 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 GEMP55040 296 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 PTSQ03393 145 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 INPP5AQ14642 412 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 SHBQ15464 509 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 CDKN3Q16667 212 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 Q6ZVL8 140 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 NUS1Q96E22 293 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 PBKQ96KB5 322 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 SCN8AQ9UQD0 1980 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 YKT6O15498 198 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 PCDHGA12O60330 932 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 KCNK5O95279 499 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 CLDN7O95471 211 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 PCCBP05166 539 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 C1SP09871 688 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 THOP1P52888 689 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 GDF10P55107 478 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 SNX1Q13596 522 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 FZD2Q14332 565 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 PRPSAP1Q14558 356 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 CCNG2Q16589 344 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 LONRF2Q1L5Z9 754 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 DBX2Q6ZNG2 339 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 PIP4P1Q86T03 277 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 IPMKQ8NFU5 416 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 RTP4Q96DX8 246 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 APOOQ9BUR5 198 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 LRP4O75096 1905 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-208ENST00000528920 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms