RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	AREL1	O15033	823 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	VAPB	O95292	243 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	EGF	P01133	1207 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	HLA-E	P13747	358 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP5D	P30049	168 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	ABL2	P42684	1182 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	PTS	Q03393	145 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	GRTP1	Q5TC63	336 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	CES3	Q6UWW8	571 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNMB4	Q86W47	210 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2T3	Q8NH03	318 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	HDAC10	Q969S8	669 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	MTBP	Q96DY7	904 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	PAFAH2	Q99487	392 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	MTG2	Q9H4K7	406 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	RAD18	Q9NS91	495 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	SENP1	Q9P0U3	644 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	SARDH	Q9UL12	918 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	KCTD3	Q9Y597	815 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	ARL5A	Q9Y689	179 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	COL4A3	Q01955	1670 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	AGAP14	A8MT82	685 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMD11	O00231	422 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	AP1G1	O43747	822 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	BNIP3L	O60238	219 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAM23	O75077	832 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT38	O76015	456 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	INHBA	P08476	426 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	ERVK-10	P10266	1014 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	C5AR1	P21730	350 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	VIPR1	P32241	457 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	GP5	P40197	560 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	ARSD	P51689	593 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC18A1	P54219	525 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	XIAP	P98170	497 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	EOGT	Q5NDL2	527 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	IER5L	Q5T953	404 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	DPPA4	Q7L190	304 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	TTC7B	Q86TV6	843 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4L1	Q8NH43	312 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	MZB1	Q8WU39	189 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	ARL8A	Q96BM9	186 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	TBATA	Q96M53	351 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	ZFAT	Q9P243	1243 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	APPL1	Q9UKG1	709 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	PKP3	Q9Y446	797 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	F5	P12259	2224 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	MYO10	Q9HD67	2058 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	COL4A2	P08572	1712 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PQF6	199 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	TLDC2	A0PJX2	215 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT37	O76014	449 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	CLDN7	O95471	211 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	ADH1B	P00325	375 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	ALPI	P09923	528 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	PIRT	P0C851	137 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	CHRNB1	P11230	501 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	TIE1	P35590	1138 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	STC1	P52823	247 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TRAF4-208	ENST00000469529	COPA	P53621	1224 aa		12.74	□□□□□ -0.37

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