RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 MGAT5BQ3V5L5 792 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 SLCO4A1Q96BD0 722 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 TADA1Q96BN2 335 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 RANBP9Q96S59 729 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 VPS28Q9UK41 221 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 FAM50BQ9Y247 325 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 BTRCQ9Y297 605 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 FRMPD3Q5JV73 1810 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 GPR39O43194 453 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 SLC7A4O43246 635 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 AHCYL1O43865 530 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 SPATA31D3P0C874 917 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 SLC2A3P11169 496 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 MTHFD2P13995 350 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 IMPDH1P20839 514 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 GRM2Q14416 872 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 PFKFB4Q16877 469 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 KLC3Q6P597 504 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 CALML6Q8TD86 181 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 LRTOMTQ8WZ04 291 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 LPGAT1Q92604 370 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 ESAMQ96AP7 390 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 SLC22A2O15244 555 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 PEX1O43933 1283 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 DNAJB1P25685 340 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 GSTT1P30711 240 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 SOX11P35716 441 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 CHN2P52757 468 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 RGMBQ6NW40 437 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 IYDQ6PHW0 289 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 BTN2A3PQ96KV6 586 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 C8orf48Q96LL4 319 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 SPATA16Q9BXB7 569 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 VCX3BQ9H321 246 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 TUBB1Q9H4B7 451 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 AKTIPQ9H8T0 292 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 TET1Q8NFU7 2136 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 TMEM88BA6NKF7 163 aa15.58■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 TRIM38O00635 465 aa15.58■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 GPC4O75487 556 aa15.58■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 CDK14O94921 469 aa15.58■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 RBP1P09455 135 aa15.58■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 FDXRP22570 491 aa15.58■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 SGSHP51688 502 aa15.58■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 APLP1P51693 650 aa15.58■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 MYBPC1Q00872 1141 aa15.58■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 C6orf10Q5SRN2 563 aa15.58■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 TAS1R1Q7RTX1 841 aa15.58■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 AMIGO2Q86SJ2 522 aa15.58■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 SLC30A3Q99726 388 aa15.58■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 MED16Q9Y2X0 877 aa15.58■□□□□ 0.09
NISCH-202ENST00000420808 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 C7orf72A4D263 438 aa15.58■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 TRIM24O15164 1050 aa15.58■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 DUSP4Q13115 394 aa15.58■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 LGI2Q8N0V4 545 aa15.58■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa15.58■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa15.58■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 C19orf60Q96EN9 201 aa15.58■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 FBXO44Q9H4M3 255 aa15.58■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 MRASO14807 208 aa15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 PIP5K1BO14986 540 aa15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 ATP6V1B1P15313 513 aa15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 RPS24P62847 133 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 SQLEQ14534 574 aa15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 RTP2Q5QGT7 225 aa15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 LRRC49Q8IUZ0 686 aa15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 GALNT15Q8N3T1 639 aa15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 METTL25Q8N6Q8 603 aa15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 TRPC4APQ8TEL6 797 aa15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 MID1IP1Q9NPA3 183 aa15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
NISCH-202ENST00000420808 A0A1B0GVG6 124 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67 ms