RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357179.9

TOP3B-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOP3B, Length 2,863 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-201ENST00000357179 CCDC78A2IDD5 438 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 NTRK1P04629 796 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 FCGR1AP12314 374 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 BMP4P12644 408 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 CXCR2P25025 360 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 OXTRP30559 389 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 ABCG1P45844 678 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 SLC12A1Q13621 1099 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 CTF1Q16619 201 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 SPARTQ8N0X7 666 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 PIK3C3Q8NEB9 887 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 TP53INP1Q96A56 240 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 AGAP2Q99490 1192 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 SP140LQ9H930 580 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 NME7Q9Y5B8 376 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 TARM1B6A8C7 271 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 TOR1BO14657 336 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 DNAJB1P25685 340 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 HTR1BP28222 390 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 C14orf80Q86SX3 495 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 SCML4Q8N228 414 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 ROPN1LQ96C74 230 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 HSFY1Q96LI6 401 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 MUS81Q96NY9 551 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 SNX25Q9H3E2 840 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 MARCH7Q9H992 704 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 POLE4Q9NR33 117 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 BFARQ9NZS9 450 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 MAGEB16A2A368 324 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 NME4O00746 187 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 UBDO15205 165 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 AP2A1O95782 977 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 RFC2P35250 354 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 MATKP42679 507 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 SLC25A52Q3SY17 297 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 ANKK1Q8NFD2 765 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 MFSD3Q96ES6 412 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 CASS4Q9NQ75 786 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 ZNF639Q9UID6 485 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 A0A1W2PQ67 120 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 H0Y858 1186 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 DLX3O60479 287 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 CRHBPP24387 322 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 TAS2R42Q7RTR8 314 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 C11orf74Q86VG3 221 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 LEMD2Q8NC56 503 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 RNF139Q8WU17 664 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 RNF38Q9H0F5 515 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 NEK6Q9HC98 313 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 TLR9Q9NR96 1032 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 FZD1Q9UP38 647 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 ASNA1O43681 348 aa14.67□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 SCO2O43819 266 aa14.67□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 NPHS1O60500 1241 aa14.67□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 GPIP06744 558 aa14.67□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 GJA9P57773 515 aa14.67□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 BNIP2Q12982 314 aa14.67□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.67□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 LACC1Q8IV20 430 aa14.67□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.67□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.67□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TOP3B-201ENST00000357179 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms