RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 CACNA1AO00555 2505 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 A0A0J9YYE9 177 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 H7C0C1 242 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 MTSS1O43312 755 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 CBFA2T3O75081 653 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 TRBC1P01850 177 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 CEACAM1P13688 526 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 RBL1P28749 1068 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 ATP5OP48047 213 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 FZD2Q14332 565 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 USP45Q70EL2 814 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 ERMP1Q7Z2K6 904 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 GATAD2AQ86YP4 633 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 ZNF567Q8N184 647 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 OXR1Q8N573 874 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 PLA2G15Q8NCC3 412 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 SAP25Q8TEE9 199 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 PDLIM2Q96JY6 352 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 TRIB3Q96RU7 358 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 KCNF1Q9H3M0 494 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 BTBD3Q9Y2F9 522 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 LRRK1Q38SD2 2015 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa15.75■□□□□ 0.11
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ACTB-206ENST00000443528 FLRT2O43155 660 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
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ACTB-206ENST00000443528 CA4P22748 312 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 NFKBIAP25963 317 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
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ACTB-206ENST00000443528 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 NDUFAF2Q8N183 169 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 LPCAT1Q8NF37 534 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15.75■□□□□ 0.11
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ACTB-206ENST00000443528 SLC32A1Q9H598 525 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa15.75■□□□□ 0.11
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ACTB-206ENST00000443528 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 INPP5AQ14642 412 aa15.74■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 QPCTQ16769 361 aa15.74■□□□□ 0.11
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ACTB-206ENST00000443528 PID1Q7Z2X4 250 aa15.74■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 KDELC2Q7Z4H8 507 aa15.74■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 PELI3Q8N2H9 469 aa15.74■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 RHBDD1Q8TEB9 315 aa15.74■□□□□ 0.11
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ACTB-206ENST00000443528 ALS2CR12Q96Q35 445 aa15.74■□□□□ 0.11
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ACTB-206ENST00000443528 USP29Q9HBJ7 922 aa15.74■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 UBP1Q9NZI7 540 aa15.74■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 KLF15Q9UIH9 416 aa15.74■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.73■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 PSMD11O00231 422 aa15.73■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 SDC3O75056 442 aa15.73■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 ITGAVP06756 1048 aa15.73■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 ETV3P41162 512 aa15.73■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 CDK18Q07002 472 aa15.73■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 MTM1Q13496 603 aa15.73■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 ARHGEF7Q14155 803 aa15.73■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 GALNT3Q14435 633 aa15.73■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 RPS6KA1Q15418 735 aa15.73■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 PCSK7Q16549 785 aa15.73■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 CDKN3Q16667 212 aa15.73■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
ACTB-206ENST00000443528 KDELC1Q6UW63 502 aa15.73■□□□□ 0.11
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