RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 FBXO5Q9UKT4 447 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 CCDC162PA2VCL2 907 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 TBX10O75333 385 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 PGLSO95336 258 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 GOT2P00505 430 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 VIMP08670 466 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 SLC18A1P54219 525 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 IL9RQ01113 521 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 SLC20A2Q08357 652 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 ARMC12Q5T9G4 340 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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VSX1-205ENST00000429762 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 AHI1Q8N157 1196 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 CIPCQ9C0C6 399 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 VPS11Q9H270 941 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 MTG2Q9H4K7 406 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 BPIFA1Q9NP55 256 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 GDE1Q9NZC3 331 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 CDH7Q9ULB5 785 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 SLC39A10Q9ULF5 831 aa22.18■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 ERVW-1Q9UQF0 538 aa22.18■■□□□ 1.14
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VSX1-205ENST00000429762 CISD3P0C7P0 127 aa22.17■■□□□ 1.14
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VSX1-205ENST00000429762 TYK2P29597 1187 aa22.17■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 DGKGP49619 791 aa22.17■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 ADAM15Q13444 863 aa22.17■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 C16orf46Q6P387 395 aa22.17■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 VITQ6UXI7 678 aa22.17■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.17■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 ZSWIM9Q86XI8 627 aa22.17■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 CHST14Q8NCH0 376 aa22.17■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 OR4K2Q8NGD2 314 aa22.17■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 PIH1D2Q8WWB5 315 aa22.17■■□□□ 1.14
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VSX1-205ENST00000429762 CCDC134Q9H6E4 229 aa22.17■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa22.17■■□□□ 1.14
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VSX1-205ENST00000429762 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.16■■□□□ 1.14
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VSX1-205ENST00000429762 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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VSX1-205ENST00000429762 MRGPRX3Q96LB0 322 aa22.16■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 HPS4Q9NQG7 708 aa22.16■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 CLDND1Q9NY35 253 aa22.16■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 FBXO10Q9UK96 956 aa22.16■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 COL4A3Q01955 1670 aa22.15■■□□□ 1.14
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VSX1-205ENST00000429762 SLC7A4O43246 635 aa22.15■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 ETV4P43268 484 aa22.15■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 CSNK1DP48730 415 aa22.15■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 DNAJC3Q13217 504 aa22.15■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.15■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 ZNF366Q8N895 744 aa22.15■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 GPATCH11Q8N954 259 aa22.15■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 ARMC2Q8NEN0 867 aa22.15■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 NXPE3Q969Y0 559 aa22.15■■□□□ 1.14
VSX1-205ENST00000429762 MAGEB18Q96M61 343 aa22.15■■□□□ 1.14
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