RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 FRMD3A2A2Y4 597 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 A8MZ25 164 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 MYO1GB0I1T2 1018 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 VILLO15195 856 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 NDUFB8O95169 186 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 OR2C1O95371 312 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 TFPIP10646 304 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 TMEM163Q8TC26 289 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SLC35F5Q8WV83 523 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 NEUROD6Q96NK8 337 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 MAGEE1Q9HCI5 957 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 BPIFA1Q9NP55 256 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 FZD3Q9NPG1 666 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 MYF6P23409 242 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 ADGRF2Q8IZF7 708 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 HUS1BQ8NHY5 278 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 GPT2Q8TD30 523 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 OTULINQ96BN8 352 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGEF26Q96DR7 871 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 CMTM3Q96MX0 182 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SLITRK1Q96PX8 696 aa3.23□□□□□ -1.89
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