RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 GCATO75600 419 aa18.45■□□□□ 0.54
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PTX4-201ENST00000293922 CTSLP07711 333 aa18.45■□□□□ 0.54
PTX4-201ENST00000293922 PTPN3P26045 913 aa18.45■□□□□ 0.54
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PTX4-201ENST00000293922 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
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PTX4-201ENST00000293922 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa18.43■□□□□ 0.54
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PTX4-201ENST00000293922 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
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PTX4-201ENST00000293922 SLC7A4O43246 635 aa18.42■□□□□ 0.54
PTX4-201ENST00000293922 CER1O95813 267 aa18.42■□□□□ 0.54
PTX4-201ENST00000293922 ETS1P14921 441 aa18.42■□□□□ 0.54
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PTX4-201ENST00000293922 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa18.42■□□□□ 0.54
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa18.42■□□□□ 0.54
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PTX4-201ENST00000293922 CEP41Q9BYV8 373 aa18.42■□□□□ 0.54
PTX4-201ENST00000293922 KDM4CQ9H3R0 1056 aa18.42■□□□□ 0.54
PTX4-201ENST00000293922 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP18.42■□□□□ 0.54
PTX4-201ENST00000293922 PAK5Q9P286 719 aa18.42■□□□□ 0.54
PTX4-201ENST00000293922 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PTX4-201ENST00000293922 SEPT3Q9UH03 358 aa18.42■□□□□ 0.54
PTX4-201ENST00000293922 SNX11Q9Y5W9 270 aa18.42■□□□□ 0.54
PTX4-201ENST00000293922 PCNX2A6NKB5 2137 aa18.42■□□□□ 0.54
PTX4-201ENST00000293922 AKAP13Q12802 2813 aa18.42■□□□□ 0.54
PTX4-201ENST00000293922 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa18.41■□□□□ 0.54
PTX4-201ENST00000293922 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa18.41■□□□□ 0.54
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