RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637570.1

DCX-211, Transcript of doublecortin, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene DCX, Length 6,162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCX-211ENST00000637570 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 CCDC178Q5BJE1 867 aa7.35□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.35□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 TTC30BQ8N4P2 665 aa7.35□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 INCENPQ9NQS7 918 aa7.35□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.35□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.35□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 SIN3AQ96ST3 1273 aa7.35□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.35□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 ATP2B3Q16720 1220 aa7.34□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 RAI14Q9P0K7 980 aa7.34□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.34□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 LRRCC1Q9C099 1032 aa7.34□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 DPH6Q7L8W6 267 aa7.34□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 DAAM2Q86T65 1068 aa7.34□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 CUX2O14529 1486 aa7.34□□□□□ -1.23
DCX-211ENST00000637570 GJC1P36383 396 aa7.34□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 SYCP1Q15431 976 aa7.34□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.33□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 SIRT1Q96EB6 747 aa7.33□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 MRFAP1Q9Y605 127 aa7.33□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 ANAPC15P60006 121 aa7.33□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.33□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 CAMK4Q16566 473 aa7.33□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.33□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 BLVRAP53004 296 aa7.33□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.33□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 RNF20Q5VTR2 975 aa7.32□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 ISM2Q6H9L7 571 aa7.32□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 CEP120Q8N960 986 aa7.32□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 MICALCLQ6ZW33 695 aa7.32□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 TRIM5Q9C035 493 aa7.32□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 DNAJC5BQ9UF47 199 aa7.32□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 TRAPPC10P48553 1259 aa7.32□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa7.32□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 CFAP57Q96MR6 1250 aa7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 UBE3AQ05086 875 aa7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 VPS37DQ86XT2 251 aa7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 UBXN4Q92575 508 aa7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 ABCF2Q9UG63 623 aa7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 CNGA1P29973 690 aa7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 STMN2Q93045 179 aa7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 EZRP15311 586 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 MNAT1P51948 309 aa7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 FAM161AQ3B820 660 aa7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 PDCL2Q8N4E4 241 aa7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa7.31□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 HYPKQ9NX55 129 aa7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 GPATCH3Q96I76 525 aa7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 EPSTI1Q96J88 318 aa7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 SMC4Q9NTJ3 1288 aa7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.3□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa7.29□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 AKNAD1Q5T1N1 836 aa7.29□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.29□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 BRD3Q15059 726 aa7.29□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.29□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 IL1RL1Q01638 556 aa7.29□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 NFE2L2Q16236 605 aa7.29□□□□□ -1.24
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