RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 MORC1Q86VD1 984 aa45.2■■■■■ 4.83
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RGPD5Q99666 1765 aa45.19■■■■■ 4.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP45.18■■■■■ 4.82
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CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS72Q15906 364 aa45.17■■■■■ 4.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 EVA1CP58658 441 aa45.16■■■■■ 4.82
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CTDNEP1-209ENST00000574205 IP6K1Q92551 441 aa45.13■■■■■ 4.82
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FLT4P35916 1363 aa45.06■■■■■ 4.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR17Q8IZU2 1322 aa45.04■■■■■ 4.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa45.04■■■■■ 4.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa45.04■■■■■ 4.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP45.03■■■■■ 4.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa45■■■■■ 4.79
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP44.97■■■■■ 4.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa44.96■■■■■ 4.79
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP44.87■■■■■ 4.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 RGS12O14924 1447 aa44.87■■■■■ 4.77
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CTDNEP1-209ENST00000574205 BARGINQ6ZT62 677 aa44.85■■■■■ 4.77
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MTHFSP49914 203 aa44.83■■■■■ 4.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 RGPD2P0DJD1 1756 aa44.8■■■■■ 4.76
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CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0G2JS52 829 aa44.75■■■■■ 4.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP2R1AP30153 589 aa44.75■■■■■ 4.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYT1Q01538 1121 aa44.75■■■■■ 4.76
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CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NBPF4Q96M43 638 aa44.73■■■■■ 4.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP44.7■■■■■ 4.75
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DISP2A7MBM2 1401 aa44.68■■■■■ 4.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL2RBP14784 551 aa44.64■■■■■ 4.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 EYA1Q99502 592 aa44.64■■■■■ 4.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCAPD2Q15021 1401 aa44.63■■■■■ 4.73
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC37A3O60309 1634 aa44.61■■■■■ 4.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL13P35225 146 aa44.61■■■■■ 4.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP44.61■■■■■ 4.73
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MEGF6O75095 1541 aa44.53■■■■■ 4.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDE3BQ13370 1112 aa44.52■■■■■ 4.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNS2Q63HR2 1409 aa44.51■■■■■ 4.72
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa44.49■■■■■ 4.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 TATP17735 454 aaPredicted RBP44.47■■■■■ 4.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 KDRP35968 1356 aa44.45■■■■■ 4.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANP32CO43423 234 aa44.44■■■■■ 4.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 EP400Q96L91 3159 aa44.42■■■■■ 4.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 SULT6B1Q6IMI4 303 aa44.42■■■■■ 4.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDCQ9Y266 331 aa44.41■■■■■ 4.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa44.41■■■■■ 4.7
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