RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	CEP152	O94986	1710 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	ABCA6	Q8N139	1617 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	FCHSD2	O94868	740 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	GNAI1	P63096	354 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	CDK19	Q9BWU1	502 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	NSD2	O96028	1365 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	MYOM2	P54296	1465 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	IL16	Q14005	1332 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	ST18	O60284	1047 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	RAPGEF3	O95398	923 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	IDI1	Q13907	227 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	CD109	Q6YHK3	1445 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	HS1BP3	Q53T59	392 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM83G	A6ND36	823 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSUH2-208	ENST00000455157	TET3	O43151	1660 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	NFE2L2	Q16236	605 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	RNF214	Q8ND24	703 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	VAMP4	O75379	141 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	NUCB2	P80303	420 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	RABEP1	Q15276	862 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	KIF1B	O60333	1816 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	SHROOM2	Q13796	1616 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	CBX1	P83916	185 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	KIF2C	Q99661	725 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	NUTM2F	A1L443	756 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	PKP1	Q13835	747 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	NPAT	Q14207	1427 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	PLCB2	Q00722	1185 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	MPND	Q8N594	471 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	POLK	Q9UBT6	870 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	NEK4	P51957	841 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	KRT24	Q2M2I5	525 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	ZBTB22	O15209	634 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	REC8	O95072	547 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		13.83	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.83	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	NME9	Q86XW9	330 aa		13.83	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.83	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		13.83	□□□□□ -0.19
SSUH2-208	ENST00000455157	SYCE3	A1L190	88 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	COG3	Q96JB2	828 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	DDIT3	P35638	169 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	MLEC	Q14165	292 aa		13.83	□□□□□ -0.2

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