RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371417.3

ARRDC1-AS1-201, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC1-AS1, Length 1,409 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IP6K1Q92551 441 aa29.54■■■□□ 2.32
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NCAPD2Q15021 1401 aa29.23■■■□□ 2.27
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 USP35Q9P2H5 1018 aa29.21■■■□□ 2.27
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.18■■■□□ 2.26
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.14■■■□□ 2.26
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GLI3P10071 1580 aa29.14■■■□□ 2.26
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BARGINQ6ZT62 677 aa29.11■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IL2RBP14784 551 aa29.11■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PRKAR2BP31323 418 aa29.11■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DISP2A7MBM2 1401 aa29.1■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MEGF6O75095 1541 aa29.1■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.1■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 WNK3Q9BYP7 1800 aa29.09■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 POTEAQ6S8J7 498 aa29.07■■■□□ 2.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.07■■■□□ 2.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
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