RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF135	Q8IUD6	432 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	IFT43	Q96FT9	208 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC77	Q9BR77	488 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TRABD	Q9H4I3	376 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SUN2	Q9UH99	717 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	MROH6	A6NGR9	719 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	AGPS	O00116	658 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	USP12	O75317	370 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PGLS	O95336	258 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	C1QA	P02745	245 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	POLB	P06746	335 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PRKCH	P24723	683 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	MGAT1	P26572	445 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	CTH	P32929	405 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	BCL2L1	Q07817	233 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	MESP2	Q0VG99	397 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TDRP	Q86YL5	185 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TMIE	Q8NEW7	156 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PTPRN2	Q92932	1015 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ZIM3	Q96PE6	472 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	LYSMD1	Q96S90	227 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SH3GL2	Q99962	352 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	CIPC	Q9C0C6	399 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	HACD3	Q9P035	362 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	DKK3	Q9UBP4	350 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	HCN2	Q9UL51	889 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TSPAN11	A1L157	253 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	HEATR9	A2RTY3	570 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529		F5H423	210 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	OPA1	O60313	960 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	GJB3	O75712	270 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	CP	P00450	1065 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SRF	P11831	508 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	DRD1	P21728	446 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINA4	P29622	427 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	GRIA4	P48058	902 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PDE1B	Q01064	536 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ACVR1	Q04771	509 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAF2	Q12933	501 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TDG	Q13569	410 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ACCSL	Q4AC99	568 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	MPP5	Q8N3R9	675 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SGSM3	Q96HU1	749 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	CYTH2	Q99418	400 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	APOL2	Q9BQE5	337 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SYBU	Q9NX95	663 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		12.84	□□□□□ -0.35

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