RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM63CQ9P1W3 806 aa26.45■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCSK1NQ9UHG2 260 aa26.45■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BAHCC1Q9P281 2608 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPAN11A1L157 253 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPED1A4D0V7 1026 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGAP42A6NI28 874 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMTNL1A8MU46 457 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DAPK3O43293 454 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRRT3Q5FWE3 981 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFAP58Q5T655 872 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MACC1Q6ZN28 852 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBATAQ96M53 351 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC13A1Q9BZW2 595 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC39A8Q9C0K1 460 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM191CA6NGB0 347 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSO75390 466 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF8O76064 485 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADKP55263 362 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf61Q13536 156 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC14Q15048 493 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRF4Q15306 451 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NR0B2Q15466 257 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGP2Q16851 508 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D25Q3MII6 688 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAXCQ5TGI0 409 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERAP2Q6P179 960 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GUSBP11Q6P575 273 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLMNQ92990 594 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PEBP4Q96S96 227 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC61Q9BV99 259 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HAUS4Q9H6D7 363 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDH12Q9NPG4 1184 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COQ6Q9Y2Z9 468 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRPSAP2O60256 369 aa26.42■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP12O75317 370 aa26.42■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GCATO75600 419 aa26.42■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FTLP02792 175 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRAT1Q6PJG6 821 aa26.42■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFX8Q6ZV50 586 aa26.42■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa26.42■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AIPL1Q9NZN9 384 aa26.42■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LMO7DNF2Z398 122 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PALMO75781 387 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPOP05164 745 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANXA6P08133 673 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GZMAP12544 262 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C6P13671 934 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSNK1DP48730 415 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPIAP49247 311 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPARDQ03181 441 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WSCD2Q2TBF2 565 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRLQ86TD4 932 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAMK1DQ8IU85 385 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FNIP1Q8TF40 1166 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BOCQ9BWV1 1114 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM7Q9C029 511 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PQC6 194 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERCC2P18074 760 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TGM2P21980 687 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIPP30301 263 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKCIP41743 596 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIG3P49916 1009 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PEX5P50542 639 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BLKP51451 505 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABREP78334 506 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AFMIDQ63HM1 303 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LSMEM2Q8N112 164 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPCN2Q8NHX9 752 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SP110Q9HB58 689 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DFFAO00273 331 aa26.39■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUSKO15146 869 aa26.39■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YY2O15391 372 aa26.39■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSHRP16473 764 aa26.39■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINA4P29622 427 aa26.39■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MMP12P39900 470 aa26.39■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGRP47804 291 aa26.39■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL30Q0D2K2 578 aa26.39■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC173Q0VFZ6 552 aa26.39■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACAP1Q15027 740 aa26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms