RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520400.5

CTNNA1-222, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 4

Gene CTNNA1, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-222	ENST00000520400	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	PSAT1	Q9Y617	370 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400		A0A1W2PQF6	199 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	LIAS	O43766	372 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	KLK8	O60259	260 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	MLYCD	O95822	493 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	FMO4	P31512	558 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	DCTD	P32321	178 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	PBX3	P40426	434 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	CLCN5	P51795	746 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	HSPB2	Q16082	182 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	HYI	Q5T013	277 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	CUL5	Q93034	780 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	MDM4	O15151	490 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	DOK2	O60496	412 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	IFNA2	P01563	188 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	YWHAQ	P27348	245 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	THPO	P40225	353 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	POLD2	P49005	469 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	SELENOV	P59797	346 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	CAPS	Q13938	189 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	DUSP6	Q16828	381 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	DPP10	Q8N608	796 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	NES	P48681	1621 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400		A0A0U1RQF3	1178 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	TAF4	O00268	1085 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	EBAG9	O00559	213 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	LDB2	O43679	373 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	PTP4A3	O75365	173 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC2A4	P14672	509 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	CHRNB2	P17787	502 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	ITGAX	P20702	1163 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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