RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 CD300LFQ8TDQ1 290 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 PHF20Q9BVI0 1012 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 UPP2O95045 317 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 CYBBP04839 570 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 MPOP05164 745 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 TPBGLP0DKB5 382 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 NR4A1P22736 598 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 CFAP97Q9P2B7 532 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 PNMA3Q9UL41 463 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 ERVK-24P63145 666 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 PIK3R6Q5UE93 754 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 PLA2G4FQ68DD2 849 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 AMIGO1Q86WK6 493 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 AGPAT1Q99943 283 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 CYP4F12Q9HCS2 524 aa11.28□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 H7C1W4 665 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 UBDO15205 165 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 TADA2AO75478 443 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 CCR3P51677 355 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 STRIP1Q5VSL9 837 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 CFAP206Q8IYR0 622 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC4A11Q8NBS3 891 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF232Q9UNY5 417 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 ABCA4P78363 2273 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 CLCA1A8K7I4 914 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 E7ENX8 843 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 ADAM8P78325 824 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF621Q6ZSS3 439 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 SLITRK4Q8IW52 837 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 GRIA3P42263 894 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 DUOXA2Q1HG44 320 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 QSOX2Q6ZRP7 698 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 MYO1HQ8N1T3 1032 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 CPA5Q8WXQ8 436 aa11.27□□□□□ -0.6
HDGFL3-201ENST00000299633 USP32Q8NFA0 1604 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 NPY2RP49146 381 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 PRKAA2P54646 552 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 CYP2R1Q6VVX0 501 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 REPS1Q96D71 796 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 CHST12Q9NRB3 414 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 VPS51Q9UID3 782 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 COL15A1P39059 1388 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 RPA1P27694 616 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 ST8SIA6P61647 398 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 RNF220Q5VTB9 566 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 IQSEC2Q5JU85 1478 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 TVP23AA6NH52 213 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 SCGB2A2Q13296 93 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 GRAPQ13588 217 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 SEMA3AQ14563 771 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 ATL1Q8WXF7 558 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 FDFT1P37268 417 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 CENPCQ03188 943 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 HERC3Q15034 1050 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 AUTS2Q8WXX7 1259 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 ITIH6Q6UXX5 1313 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 M0QX08 132 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 CYP26A1O43174 497 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 PGRP06401 933 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC2A4P14672 509 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 SMIM11AP58511 58 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 BNIP2Q12982 314 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC16A9Q7RTY1 509 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 POU5F2Q8N7G0 328 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 PITPNAQ00169 270 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 MGAT5Q09328 741 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 MCPH1Q8NEM0 835 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 SETD6Q8TBK2 473 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 REM1O75628 298 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 BBOX1O75936 387 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF844Q08AG5 666 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 PAGE2Q7Z2X7 111 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 ARPINQ7Z6K5 226 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 CCDC74AQ96AQ1 378 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 CHIAQ9BZP6 476 aa11.27□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa11.26□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 L7N2F9 121 aa11.26□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 BGNP21810 368 aa11.26□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 RBM34P42696 430 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 VAMP2P63027 116 aa11.26□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 CATSPER4Q7RTX7 472 aa11.26□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 ATCAYQ86WG3 371 aa11.26□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 NSMCE3Q96MG7 304 aa11.26□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa11.26□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 PRKD3O94806 890 aa11.26□□□□□ -0.61
HDGFL3-201ENST00000299633 FADS2O95864 444 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.5 ms