RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598902.5

LINC01515-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1515, human

TSL 5

Gene LINC01515, Length 778 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01515-208	ENST00000598902	MYF6	P23409	242 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	LYL1	P12980	280 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	CHN1	P15882	459 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	ABCB4	P21439	1286 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	BTK	Q06187	659 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	CALCRL	Q16602	461 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	CD101	Q93033	1021 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01515-208	ENST00000598902	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	TIMM23	O14925	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	SYN3	O14994	580 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	SERPINA4	P29622	427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	AVPR2	P30518	371 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	TEC	P42680	631 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	STARD3	Q14849	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	ACTL6B	O94805	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	VNN2	O95498	520 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	PMS2P2	O95744	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	CYP21A2	P08686	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	ARSA	P15289	507 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	MYD88	Q99836	296 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	FFAR2	O15552	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	STRN	O43815	780 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	LDLR	P01130	860 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	CFC1	P0CG37	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	AP2B1	P63010	937 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	TRIB2	Q92519	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	CLPB	Q9H078	707 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	CPED1	A4D0V7	1026 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	GYS1	P13807	737 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	GJC1	P36383	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	PHEX	P78562	749 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	LPIN1	Q14693	890 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	FCN2	Q15485	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	RPE65	Q16518	533 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms