RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567377.5

COMMD4-218, Transcript of COMM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene COMMD4, Length 461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4-218ENST00000567377 DNA2P51530 1060 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 METAP1P53582 386 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 ARSIQ5FYB1 569 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 ERMARDQ5T6L9 678 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 FAM174AQ8TBP5 190 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 SLC6A18Q96N87 628 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 TNKS2Q9H2K2 1166 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 EBF2Q9HAK2 575 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 IL21RQ9HBE5 538 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 GDF3Q9NR23 364 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 NDFIP2Q9NV92 336 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 CAPN11Q9UMQ6 739 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 WASF2Q9Y6W5 498 aa18.5■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 A0A1W2PR77 199 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 TLR4O00206 839 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 CREB3O43889 395 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 CBFA2T3O75081 653 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 LEFTY1O75610 366 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 POP4O95707 220 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 CD160O95971 181 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 SERPING1P05155 500 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 ITGB7P26010 798 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 GRK6P43250 576 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 NEK3P51956 506 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 RAD51Q06609 339 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 STAT4Q14765 748 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 PYROXD2Q8N2H3 581 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 CHST14Q8NCH0 376 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 RHBDD1Q8TEB9 315 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 RAB7BQ96AH8 199 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF653Q96CK0 615 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 A0A1B0GTQ1 180 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 H0Y8X5 98 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 PLK4O00444 970 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 AP1G1O43747 822 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 PRPSAP2O60256 369 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 SKILP12757 684 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 NDST2P52849 883 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 TAS2R38P59533 333 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 TPI1P60174 286 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 PPP2CBP62714 309 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 PPP2CAP67775 309 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 OGDHQ02218 1023 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 FOXC1Q12948 553 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 POM121L1PQ3SYA9 428 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 FBXL19Q6PCT2 694 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 HORMAD1Q86X24 394 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF354CQ86Y25 554 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 OR2AP1Q8NGE2 309 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 ARRDC3Q96B67 414 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 ARHGEF26Q96DR7 871 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 FEM1CQ96JP0 617 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 MAGEB5Q9BZ81 275 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 AP4E1Q9UPM8 1137 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 WASF3Q9UPY6 502 aa18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 RASA4BC9J798 803 aa18.47■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 RASA4O43374 803 aa18.47■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 BUB1O43683 1085 aa18.47■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 PCK1P35558 622 aa18.47■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 HCAR3P49019 387 aa18.47■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 SERINC3Q13530 473 aa18.47■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 HGSNATQ68CP4 663 aa18.47■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa18.47■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 A0A1W2PQU0 124 aa18.46■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 CBFA2T2O43439 604 aa18.46■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 PCDH8O95206 1070 aa18.46■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 WNT1P04628 370 aa18.46■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 ADRB3P13945 408 aa18.46■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 AKT2P31751 481 aa18.46■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 RXRGP48443 463 aa18.46■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 NXPH1P58417 271 aa18.46■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 RPS21P63220 83 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
COMMD4-218ENST00000567377 GRM3Q14832 879 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms