RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 PSTPIP1O43586 416 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 NDUFS2O75306 463 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 GSRP00390 522 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 CTSLP07711 333 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 TNNT1P13805 278 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 PI4KAP42356 2102 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 DNA2P51530 1060 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 ARHGAP8P85298 464 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 CYTH1Q15438 398 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 DAAM2Q86T65 1068 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 FAM124AQ86V42 546 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 AADATQ8N5Z0 425 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 PQLC3Q8N755 202 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 TMIEQ8NEW7 156 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 RNF157Q96PX1 679 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 OMDQ99983 421 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 SERGEFQ9UGK8 458 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 FZD4Q9ULV1 537 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 WASF2Q9Y6W5 498 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 CACNA1BQ00975 2339 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 A0A0U1RQJ8 604 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1W2PP55 124 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 PRNPP04156 253 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 ACSL1P33121 698 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 DRD3P35462 400 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 PTGER3P43115 390 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 METAP1P53582 386 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 RHOAP61586 193 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 DEFB119Q8N690 84 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 CADM4Q8NFZ8 388 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 KIAA1524Q8TCG1 905 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 GANCQ8TET4 914 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 FAM131CQ96AQ9 280 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 GPR174Q9BXC1 333 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 PCED1AQ9H1Q7 454 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 SP110Q9HB58 689 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 SGK2Q9HBY8 427 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 PARD6AQ9NPB6 346 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 LHX3Q9UBR4 397 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 TRIM10Q9UDY6 481 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 IL36AQ9UHA7 158 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 ANKRD36A6QL64 1941 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 DCDC2BA2VCK2 349 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 MFSD11O43934 449 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 MAFKO60675 156 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 LRP3O75074 770 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 SEMA4FO95754 770 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 TGM1P22735 817 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 MARCKSL1P49006 195 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 CCZ1BP86790 482 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF33AQ06730 810 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 TAZQ16635 292 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 MYLK3Q32MK0 819 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 ODF2Q5BJF6 829 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 ARSIQ5FYB1 569 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 LYSMD4Q5XG99 296 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 FOXJ1Q92949 421 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF599Q96NL3 588 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms