RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520400.5

CTNNA1-222, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 4

Gene CTNNA1, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-222	ENST00000520400	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400		F8W810	466 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC25A17	O43808	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	DDIT3	P35638	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	DPP6	P42658	865 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CXCR3	P49682	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CCR9	P51686	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	ARSF	P54793	590 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	NFKBID	Q8NI38	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMCC1	O94876	653 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	UBL4A	P11441	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	PRF1	P14222	555 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	GPD2	P43304	727 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CLDN2	P57739	230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	DCAF7	P61962	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	KRT32	Q14532	448 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CADM3	Q8N126	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SNAP23	O00161	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CLDN7	O95471	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	GALT	P07902	379 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC16A2	P36021	539 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	HSPB6	O14558	160 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	EPN2	O95208	641 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	IL1A	P01583	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	COX7A2	P14406	83 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	TTK	P33981	857 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	ABCG1	P45844	678 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	GAD2	Q05329	585 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTNNA1-222	ENST00000520400	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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