RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267970.8

TSPAN3-201, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN3, Length 6,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-201ENST00000267970 OR56A5P0C7T3 313 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 MYBPC1Q00872 1141 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 POMZP3Q6PJE2 187 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 WDR59Q6PJI9 974 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 C10orf107Q8IVU9 208 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 MT-ND1P03886 318 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 IFNA16P05015 189 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 SEPHS1P49903 392 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 TAB1Q15750 504 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 DEF8Q6ZN54 512 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 CDYL2Q8N8U2 506 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 PNMA5Q96PV4 448 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 NAT9Q9BTE0 207 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 TM6SF2Q9BZW4 377 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 TPK1Q9H3S4 243 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 COMMD9Q9P000 198 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 EML1O00423 815 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 CTPS1P17812 591 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ADRA2BP18089 450 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 JAK1P23458 1154 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 AQP1P29972 269 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 RPL4P36578 427 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 CTBP1Q13363 440 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 CETPP11597 493 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 RCVRNP35243 200 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ABRQ12979 859 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 RAP1GAP2Q684P5 730 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF544Q6NX49 715 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 IKBIPQ70UQ0 350 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 LEMD2Q8NC56 503 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 HES2Q9Y543 173 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 PIK3CGP48736 1102 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 PGM5Q15124 567 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 PALB2Q86YC2 1186 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ABCC3O15438 1527 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 QRICH2Q9H0J4 1663 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 RCCD1A6NED2 376 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 GPR1P46091 355 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 GRIK4Q16099 956 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 MCOLN3Q8TDD5 553 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 C17orf75Q9HAS0 396 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF180Q9UJW8 692 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 CDH9Q9ULB4 789 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 RGL2O15211 777 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 FAM155BO75949 473 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 LSM8O95777 96 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 FAM171BQ6P995 826 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 SIPA1Q96FS4 1042 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ZBTB14O43829 449 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 TIPRLO75663 272 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 IL12AP29459 219 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 QPRTQ15274 297 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF484Q5JVG2 852 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 SULT1C3Q6IMI6 304 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ZFP1Q6P2D0 407 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 RAD51AP1Q96B01 352 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 GANQ9H2C0 597 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 AHSPQ9NZD4 102 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 SLC26A4O43511 780 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 SLITRK3O94933 977 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 OR5F1O95221 314 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 KDELR1P24390 212 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ULK2Q8IYT8 1036 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 GSTCDQ8NEC7 633 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 UCMAQ8WVF2 138 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ULBP1Q9BZM6 244 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 TELO2Q9Y4R8 837 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ALDH2P05091 517 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 KLRC2P26717 231 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 MMP13P45452 471 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 BCL2L1Q07817 233 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ACSM2AQ08AH3 577 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ACSM2BQ68CK6 577 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 MAGEB16A2A368 324 aa16.96■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 C9JVG2 144 aa16.96■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 FBXO21O94952 628 aa16.96■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 PSME3P61289 254 aa16.96■□□□□ 0.31
TSPAN3-201ENST00000267970 ARF1P84077 181 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms