RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 XRCC4Q13426 336 aa18.96■□□□□ 0.63
PRRT1-201ENST00000211413 PPP1R7Q15435 360 aa18.96■□□□□ 0.63
PRRT1-201ENST00000211413 RNF43Q68DV7 783 aa18.96■□□□□ 0.63
PRRT1-201ENST00000211413 RNF135Q8IUD6 432 aa18.96■□□□□ 0.63
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.96■□□□□ 0.63
PRRT1-201ENST00000211413 MAGEH1Q9H213 219 aa18.96■□□□□ 0.63
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa18.96■□□□□ 0.63
PRRT1-201ENST00000211413 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PRRT1-201ENST00000211413 HOMER3Q9NSC5 361 aa18.96■□□□□ 0.63
PRRT1-201ENST00000211413 MARK1Q9P0L2 795 aa18.96■□□□□ 0.63
PRRT1-201ENST00000211413 TTLL3Q9Y4R7 772 aa18.96■□□□□ 0.63
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PRRT1-201ENST00000211413 ADH1CP00326 375 aa18.95■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 SHBGP04278 402 aa18.95■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 CISD3P0C7P0 127 aa18.95■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 MX2P20592 715 aa18.95■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 PTPN3P26045 913 aa18.95■□□□□ 0.62
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PRRT1-201ENST00000211413 SLMAPQ14BN4 828 aa18.95■□□□□ 0.62
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PRRT1-201ENST00000211413 PARP15Q460N3 678 aa18.95■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 ICE2Q659A1 982 aa18.95■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
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PRRT1-201ENST00000211413 E2F7Q96AV8 911 aa18.95■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 ERLEC1Q96DZ1 483 aa18.95■□□□□ 0.62
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PRRT1-201ENST00000211413 OXCT1P55809 520 aa18.94■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 PLEKHG6Q3KR16 790 aa18.94■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 PITRM1Q5JRX3 1037 aa18.94■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa18.94■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF567Q8N184 647 aa18.94■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa18.94■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 C5orf60A6NFR6 353 aa18.94■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
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PRRT1-201ENST00000211413 ZMPSTE24O75844 475 aa18.94■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA0754O94854 1291 aa18.94■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 CCNB1P14635 433 aa18.94■□□□□ 0.62
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PRRT1-201ENST00000211413 OPRD1P41143 372 aa18.94■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 SLC29A2Q14542 456 aa18.94■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 C6orf89Q6UWU4 347 aa18.94■□□□□ 0.62
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PRRT1-201ENST00000211413 MATN3O15232 486 aa18.93■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 KDELR3O43731 214 aa18.93■□□□□ 0.62
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PRRT1-201ENST00000211413 METTL18O95568 372 aa18.93■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 CD68P34810 354 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 DGKGP49619 791 aa18.93■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa18.93■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa18.93■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa18.93■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 TXNDC11Q6PKC3 985 aa18.93■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 PID1Q7Z2X4 250 aa18.93■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 ADIPOR2Q86V24 386 aa18.93■□□□□ 0.62
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PRRT1-201ENST00000211413 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
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PRRT1-201ENST00000211413 HEBP1Q9NRV9 189 aa18.93■□□□□ 0.62
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PRRT1-201ENST00000211413 ASIC3Q9UHC3 531 aa18.93■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 FBXO10Q9UK96 956 aa18.93■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 NCAM2O15394 837 aa18.92■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 LIG3P49916 1009 aa18.92■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 GPS1Q13098 491 aa18.92■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 OLIG2Q13516 323 aa18.92■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 CPA6Q8N4T0 437 aa18.92■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 NT5MQ9NPB1 228 aa18.92■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP18.92■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 WHRNQ9P202 907 aa18.92■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 RAD54BQ9Y620 910 aa18.92■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 HLA-DQB2P05538 268 aa18.92■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 BMP1P13497 986 aa18.92■□□□□ 0.62
PRRT1-201ENST00000211413 RGRP47804 291 aa18.92■□□□□ 0.62
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