RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556765.1

TRAPPC6B-206, Transcript of trafficking protein particle complex 6B, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC6B, Length 664 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 YIPF1Q9Y548 306 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 PRAMEF12O95522 483 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DRD1P21728 446 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CCR1P32246 355 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 PQLC3Q8N755 202 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 H7C0C1 242 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 MTSS1O43312 755 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 NUDT17P0C025 328 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 ATP5OP48047 213 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 FBXO32Q969P5 355 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 CSH2P0DML3 217 aa14.58□□□□□ -0.08
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 HSD17B3P37058 310 aa14.58□□□□□ -0.08
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 GPS1Q13098 491 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CBLBQ13191 982 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PLD1Q13393 1074 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RUNX3Q13761 415 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DPYSQ14117 519 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6B-206ENST00000556765 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.58□□□□□ -0.08
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 DENND2CQ68D51 928 aa14.58□□□□□ -0.08
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TRAPPC6B-206ENST00000556765 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.58□□□□□ -0.08
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