RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334		A0A1B0GVC2	190 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	ADA	P00813	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	IL1A	P01583	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	CHRM4	P08173	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	TNFSF8	P32971	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	GGT5	P36269	586 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	CLCNKB	P51801	687 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	VAMP2	P63027	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	GALNT2	Q10471	571 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	GPR68	Q15743	365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	MMP21	Q8N119	569 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	HSPH1	Q92598	858 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	EYA3	Q99504	573 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334		A6NLC8	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	SOCS2	O14508	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	CEP104	O60308	925 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	TULP3	O75386	442 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	EPN2	O95208	641 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	DPP6	P42658	865 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	LIFR	P42702	1097 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	CDH15	P55291	814 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	PKP1	Q13835	747 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	RPE65	Q16518	533 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	SERPINC1	P01008	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	ITGB6	P18564	788 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	ME3	Q16798	604 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-231	ENST00000477334	MDM4	O15151	490 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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