RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC25Q86WR0 208 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 DDIASQ8IXT1 998 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 ADGRF4Q8IZF3 695 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 DNAAF1Q8NEP3 725 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 KCNG4Q8TDN1 519 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 SORCS2Q96PQ0 1159 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 PDCL3Q9H2J4 239 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 HIPK3Q9H422 1215 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 FLRT1Q9NZU1 646 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D14Q9P2M4 693 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 LAMP3Q9UQV4 416 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 MST1RQ04912 1400 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 PI4KAP2A4QPH2 592 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 DPPA5A6NC42 116 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 PRSS47A8MTI9 375 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 F8W810 466 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 KIR2DS3K7RE56 304 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 RHODO00212 210 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 PPP6CO00743 305 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 UGDHO60701 494 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 SCGB1D1O95968 90 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 CERS1P27544 350 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 POLD2P49005 469 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 EFNA5P52803 228 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 RPS13P62277 151 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 GHRHRQ02643 423 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 STIM1Q13586 685 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 PKP1Q13835 747 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 ME3Q16798 604 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 SYTL3Q4VX76 610 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 MIDNQ504T8 468 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 SNX30Q5VWJ9 437 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TTLL5Q6EMB2 1281 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 IL20RBQ6UXL0 311 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 RRM2BQ7LG56 351 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 PRSS45Q7RTY3 260 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM74Q86UV6 250 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM73Q86UV7 250 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 C11orf65Q8NCR3 313 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 KLHL29Q96CT2 875 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 SEMA4CQ9C0C4 833 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 KRT84Q9NSB2 600 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 KIAA1456Q9P272 454 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 SWAP70Q9UH65 585 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 UTS2RQ9UKP6 389 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 SCINQ9Y6U3 715 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGAP10A1A4S6 786 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 CBY3A6NI87 242 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 TP73O15350 636 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 TGFB1I1O43294 461 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 TACC1O75410 805 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 IL1AP01583 271 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 CIITAP33076 1130 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 BSGP35613 385 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGAP25P42331 645 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 CLCNKBP51801 687 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 ARSFP54793 590 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 SETQ01105 290 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 CYP4A11Q02928 519 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 NEXNQ0ZGT2 675 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 PMPCAQ10713 525 aa3.33□□□□□ -1.88
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