RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ACTB-206ENST00000443528 TMEFF1Q8IYR6 380 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-206ENST00000443528 STK40Q8N2I9 435 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-206ENST00000443528 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ACTB-206ENST00000443528 HINFPQ9BQA5 517 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-206ENST00000443528 MAGEH1Q9H213 219 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-206ENST00000443528 ATP13A1Q9HD20 1204 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-206ENST00000443528 PARD6AQ9NPB6 346 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-206ENST00000443528 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-206ENST00000443528 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
ACTB-206ENST00000443528 UVRAGQ9P2Y5 699 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-206ENST00000443528 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
ACTB-206ENST00000443528 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CBX4O00257 560 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 MAP3K13O43283 966 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CD160O95971 181 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ACADMP11310 421 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 FECHP22830 423 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 HTR7P34969 479 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 TPI1P60174 286 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ARF5P84085 180 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 SPEM2Q0P670 501 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 SMTNL2Q2TAL5 461 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ACCSLQ4AC99 568 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 KCNT1Q5JUK3 1230 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 IL31Q6EBC2 164 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 SLC36A4Q6YBV0 504 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 LPCAT2Q7L5N7 544 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ATP11CQ8NB49 1132 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 PANX2Q96RD6 677 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ZWILCHQ9H900 591 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ACTL7AQ9Y615 435 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 RAMP2O60895 175 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 PROSCO94903 275 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 RARAP10276 462 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 GOT1P17174 413 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CD6P30203 668 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ETFBP38117 255 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 PTGER3P43115 390 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ZBTB16Q05516 673 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 DPYSL2Q16555 572 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 BOLA3Q53S33 107 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 SPDYCQ5MJ68 293 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 RFX8Q6ZV50 586 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 Q6ZVU0 165 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 DEFB119Q8N690 84 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 SLC35G2Q8TBE7 412 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ABCA7Q8IZY2 2146 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 LRP3O75074 770 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 LCA5LO95447 670 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 DNTTP04053 509 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CDC25BP30305 580 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 HCAR3P49019 387 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CLCN6P51797 869 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 SLC20A2Q08357 652 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CST6Q15828 149 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CCDC6Q16204 474 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 PLA2G2CQ5R387 149 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 RETSATQ6NUM9 610 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ARMCX6Q7L4S7 300 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CCDC170Q8IYT3 715 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 TEKT4Q8WW24 435 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 HSPH1Q92598 858 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 KLC2Q9H0B6 622 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 SERGEFQ9UGK8 458 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 INTUQ9ULD6 942 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 FAM186AA6NE01 2351 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 RASA4BC9J798 803 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 MCF2LO15068 1137 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 MID1O15344 667 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 RASA4O43374 803 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 KDELR3O43731 214 aa16.05■□□□□ 0.16
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