RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 C20orf194Q5TEA3 1177 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM69BQ5VUD6 431 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 C11orf42Q8N5U0 333 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPATA22Q8NHS9 363 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 LMBR1Q8WVP7 490 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-871P-201ENST00000516122 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 BCL2L13Q9BXK5 485 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 B3GNT4Q9C0J1 378 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC25A18Q9H1K4 315 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 SAP30LQ9HAJ7 183 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-871P-201ENST00000516122 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC85CA6NKD9 419 aa-0.51□□□□□ -2.49
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RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 AKR1A1P14550 325 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 SSTR2P30874 369 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 UQCRC1P31930 480 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 FLT3P36888 993 aa-0.51□□□□□ -2.49
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC20A2Q08357 652 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC15Q0P6D6 951 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNASE1L3Q13609 305 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTCH1Q13635 1447 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 EFNB3Q15768 340 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPDYCQ5MJ68 293 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
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RNU6-871P-201ENST00000516122 LRP11Q86VZ4 500 aa-0.51□□□□□ -2.49
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CLRN3Q8NCR9 226 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 FIG4Q92562 907 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM104AQ969W3 186 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 TXNDC15Q96J42 360 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 B3GALT6Q96L58 329 aa-0.51□□□□□ -2.49
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CTSZQ9UBR2 303 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
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RNU6-871P-201ENST00000516122 HOXC8P31273 242 aa-0.52□□□□□ -2.49
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC25A41Q8N5S1 370 aa-0.52□□□□□ -2.49
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RNU6-871P-201ENST00000516122 MIGA1Q8NAN2 632 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR52N4Q8NGI2 321 aa-0.52□□□□□ -2.49
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RNU6-871P-201ENST00000516122 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 TUBB2BQ9BVA1 445 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa-0.52□□□□□ -2.49
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RNU6-871P-201ENST00000516122 BTBD1Q9H0C5 482 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC113Q9H0I3 377 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHST8Q9H2A9 424 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 TNFRSF19Q9NS68 423 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 GTSE1Q9NYZ3 720 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 THEGQ9P2T0 379 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 RIMKLBQ9ULI2 386 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP22Q9UPT9 525 aa-0.52□□□□□ -2.49
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