RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 TM9SF3Q9HD45 589 aa27.43■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 OR51B4Q9Y5P0 310 aa27.43■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 ALOX15BO15296 676 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 TRIM16O95361 564 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 GOT1P17174 413 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 MMP8P22894 467 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 GGCXP38435 758 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 KLK7P49862 253 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 IRAK1P51617 712 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 GALCP54803 685 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 KRT83P78385 493 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 ZNF683Q8IZ20 524 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 OR8D1Q8WZ84 308 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 MUC3BQ9H195 1237 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 NEUROG2Q9H2A3 272 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 NLRC4Q9NPP4 1024 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 SERGEFQ9UGK8 458 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 WASF3Q9UPY6 502 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 DOCK4Q8N1I0 1966 aa27.42■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 A0A1B0GVT2 93 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 LRRC10BA6NIK2 292 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 DRGXA6NNA5 263 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 IL1BP01584 269 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 IGHV4-34P06331 123 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 RHOCP08134 193 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 FMO1Q01740 532 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 SYCP1Q15431 976 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 HLA-BQ31612 363 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 C6orf118Q5T5N4 469 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 FAM46CQ5VWP2 391 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 NAXDQ8IW45 347 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 NEK11Q8NG66 645 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 SLC20A1Q8WUM9 679 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 ANLNQ9NQW6 1124 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa27.41■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa27.4■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa27.4■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 A0A1W2PPC4 97 aa27.4■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 ZNF18P17022 549 aa27.4■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 CCR5P51681 352 aa27.4■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 BNC1Q01954 994 aa27.4■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 ZNF423Q2M1K9 1284 aa27.4■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 C2CD6Q53TS8 623 aa27.4■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 NCEH1Q6PIU2 408 aa27.4■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 SH2D3CQ8N5H7 860 aa27.4■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 OR52K2Q8NGK3 314 aa27.4■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 HS3ST2Q9Y278 367 aa27.4■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 FAM47DPA6NHR8 397 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 I6L893 689 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 EPHB6O15197 1021 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 SLC7A4O43246 635 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 SH3BP5O60239 455 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 CNTN5O94779 1100 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 ENDOD1O94919 500 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 RACK1P63244 317 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 DLG2Q15700 870 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 ACCSLQ4AC99 568 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 ALFQ53S48 1182 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 ZNF783Q6ZMS7 281 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 AADATQ8N5Z0 425 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 SKA1Q96BD8 255 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 CFAP57Q96MR6 1250 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 ERGIC2Q96RQ1 377 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 ORAI3Q9BRQ5 295 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 KDM4CQ9H3R0 1056 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 TM7SF3Q9NS93 570 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa27.39■■□□□ 1.98
ODC1-204ENST00000446285 C10orf142B7Z368 130 aa27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 E9PAM4 449 aa27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 CHRNB2P17787 502 aa27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 CLCN6P51797 869 aa27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 ADPRHP54922 357 aa27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 UBXN1Q04323 297 aa27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 ST3GAL2Q16842 350 aa27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 KIF19Q2TAC6 998 aa27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 TRNP1Q6NT89 227 aa27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 DCAF4L2Q8NA75 395 aa27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 FAM131CQ96AQ9 280 aa27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 CCDC114Q96M63 670 aa27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa27.38■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 MCF2LO15068 1137 aa27.37■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 FLRT2O43155 660 aa27.37■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 DFNA5O60443 496 aa27.37■■□□□ 1.97
ODC1-204ENST00000446285 UNGP13051 313 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms