RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 NUDT17P0C025 328 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ALADP13716 330 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PCID2Q5JVF3 399 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 FOXR1Q6PIV2 292 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CERS2Q96G23 380 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 YIPF2Q9BWQ6 316 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PEX5P50542 639 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 GRIK3Q13003 919 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 DPF3Q92784 378 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 INPP5DQ92835 1189 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ZFP42Q96MM3 310 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 DERAQ9Y315 318 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 TPP1O14773 563 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CILPO75339 1184 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 IGSF6O95976 241 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CKAP2Q8WWK9 683 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 MBOAT7Q96N66 472 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 LCA5LO95447 670 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 FLT3P36888 993 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CD86P42081 329 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CCNG1P51959 295 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXW4P57775 412 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ARMC12Q5T9G4 340 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 TMPRSS6Q8IU80 811 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM48Q8IWZ4 208 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 KYQ8NBH2 561 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 MID1IP1Q9NPA3 183 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 GIMAP4Q9NUV9 329 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CBX6O95503 412 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 DDR2Q16832 855 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM237Q96Q45 408 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 DMAC2Q9NW81 257 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 COG5Q9UP83 839 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 A8MX80 341 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 KATNA1O75449 491 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ALBP02768 609 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 TUSC3Q13454 348 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PPM1LQ5SGD2 360 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 WLSQ5T9L3 541 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF558Q96NG5 402 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM50BQ9Y247 325 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 NFKBIEO00221 500 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ADCY6O43306 1168 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ACADSP16219 412 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 THAP11Q96EK4 314 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ABHD2P08910 425 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PRKAA2P54646 552 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 MAP3K10Q02779 954 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM9CQ8IZT9 166 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CAAP1Q9H8G2 361 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 DCXO43602 365 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 MAPK1P28482 360 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 DAB2P98082 770 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 RASGEF1CQ8N431 466 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ZYG11BQ9C0D3 744 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 FMO4P31512 558 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 JAM2P57087 298 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CHRNB3Q05901 458 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 STARD3Q14849 445 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 GRAMD4Q6IC98 578 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ARMC6Q6NXE6 501 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 C12orf42Q96LP6 360 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 DNMT3LQ9UJW3 386 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CNTNAP1P78357 1384 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 BTN3A1O00481 513 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 DAB1O75553 588 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ELNP15502 786 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 HDCP19113 662 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PSEN1P49768 467 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 NAGLUP54802 743 aa21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms