RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	CACUL1	Q86Y37	369 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SNX19	Q92543	992 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	11.66	□□□□□ -0.54	6e-6	■□□□□ 9.5
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR174	Q9BXC1	333 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SGK2	Q9HBY8	427 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	DYRK4	Q9NR20	520 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM170A	A1A519	330 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ANTXRL	A6NF34	631 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC72	A6NJI9	287 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC30A4	O14863	429 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	GZMA	P12544	262 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CHRNB2	P17787	502 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNA4	P22459	653 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM14	Q14142	442 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ARID5B	Q14865	1188 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	NR1I3	Q14994	352 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	IQCB1	Q15051	598 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TEAD4	Q15561	434 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PTPRN	Q16849	979 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	FSCB	Q5H9T9	825 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	USP30	Q70CQ3	517 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM124A	Q86V42	546 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	EMC1	Q8N766	993 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	IGSF8	Q969P0	613 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	RMDN1	Q96DB5	314 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	EPAS1	Q99814	870 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TSPY26P	Q9H489	355 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	HCN2	Q9UL51	889 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	USP34	Q70CQ2	3546 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PQJ5	194 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	SIN3B	O75182	1162 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	SEMA4F	O95754	770 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	IL1B	P01584	269 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	C5AR1	P21730	350 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ADRA1B	P35368	520 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	PTGER3	P43115	390 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	MAPKAPK2	P49137	400 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CLCN6	P51797	869 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	COPA	P53621	1224 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC20A2	Q08357	652 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	NFKBIB	Q15653	356 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	C5orf22	Q49AR2	442 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	STPG1	Q5TH74	334 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	DEFB119	Q8N690	84 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF366	Q8N895	744 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		11.64	□□□□□ -0.55

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