RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274721.7

GFRA3-201, Transcript of GDNF family receptor alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GFRA3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3-201ENST00000274721 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 TYROBPO43914 113 aa21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 JCHAINP01591 159 aa21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 DRD4P21917 467 aa21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 RING1Q06587 406 aa21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 LRRC14Q15048 493 aa21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 KIAA1841Q6NSI8 718 aa21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 LRRC6Q86X45 466 aa21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 LRRC49Q8IUZ0 686 aa21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 CCNJLQ8IV13 435 aa21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 CNTD1Q8N815 330 aa21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 SGSM3Q96HU1 749 aa21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 RSPH14Q9UHP6 348 aa21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 ALDH1A2O94788 518 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 DEFB103AP81534 67 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 DSG1Q02413 1049 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 NUGGCQ68CJ6 796 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 SLC26A11Q86WA9 606 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 ANKRD42Q8N9B4 389 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 SMYD2Q9NRG4 433 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 ZNF180Q9UJW8 692 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 FAM159BA6NKW6 160 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 DFFAO00273 331 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 CSF2RAP15509 400 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 MIB1Q86YT6 1006 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 MGARPQ8TDB4 240 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 CKAP2Q8WWK9 683 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 ZNF558Q96NG5 402 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 IL12RB2Q99665 862 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 NAT9Q9BTE0 207 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 VANGL2Q9ULK5 521 aa21.85■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 MATN3O15232 486 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 TLR5O60602 858 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 INHBAP08476 426 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 CCNB1P14635 433 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 RHOQP17081 205 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 KRT4P19013 534 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 NFKB1P19838 968 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 MGAT1P26572 445 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 IFNAR2P48551 515 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 SPARCL1Q14515 664 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 QPCTQ16769 361 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 FAM107BQ9H098 131 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 IKBKGQ9Y6K9 419 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 SLC12A8A0AV02 714 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 ARHGAP42A6NI28 874 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 EBAG9O00559 213 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 C2CD2LO14523 706 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 KIAA0355O15063 1070 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 SPAG7O75391 227 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 FAM155BO75949 473 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 SEC24AO95486 1093 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 WDR4P57081 412 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 TPGS2Q68CL5 300 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 SH2D5Q6ZV89 423 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 OVCA2Q8WZ82 227 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 ZYG11BQ9C0D3 744 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 CASS4Q9NQ75 786 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 TMEM248Q9NWD8 314 aa21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 DRGXA6NNA5 263 aa21.83■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 WDR5P61964 334 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 CRADDP78560 199 aa21.83■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 PPM1NQ8N819 430 aa21.83■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 TTC17Q96AE7 1141 aa21.83■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 TMEM169Q96HH4 297 aa21.83■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 MLXIPLQ9NP71 852 aa21.83■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
GFRA3-201ENST00000274721 EFCAB14O75071 495 aa21.82■■□□□ 1.08
GFRA3-201ENST00000274721 ASMTLO95671 621 aa21.82■■□□□ 1.08
GFRA3-201ENST00000274721 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
GFRA3-201ENST00000274721 PGAM1P18669 254 aa21.82■■□□□ 1.08
GFRA3-201ENST00000274721 MTA1Q13330 715 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms