RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 KRT37O76014 449 aa18.58■□□□□ 0.57
USP18-201ENST00000215794 EPHB2P29323 1055 aa18.58■□□□□ 0.57
USP18-201ENST00000215794 SLC11A1P49279 550 aa18.58■□□□□ 0.57
USP18-201ENST00000215794 MROH9Q5TGP6 573 aa18.58■□□□□ 0.57
USP18-201ENST00000215794 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa18.58■□□□□ 0.57
USP18-201ENST00000215794 RNF34Q969K3 372 aa18.58■□□□□ 0.57
USP18-201ENST00000215794 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
USP18-201ENST00000215794 B3GALT6Q96L58 329 aa18.58■□□□□ 0.57
USP18-201ENST00000215794 UROC1Q96N76 676 aa18.58■□□□□ 0.57
USP18-201ENST00000215794 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
USP18-201ENST00000215794 RXFP1Q9HBX9 757 aa18.58■□□□□ 0.57
USP18-201ENST00000215794 MOCS1Q9NZB8 636 aa18.58■□□□□ 0.57
USP18-201ENST00000215794 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 F9P00740 461 aa18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 DHRS4L1P0CG22 281 aa18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 MLNP12872 115 aa18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 HCAR3P49019 387 aa18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 SLC5A3P53794 718 aa18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 CDK16Q00536 496 aa18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 TSPY1Q01534 308 aa18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 ZBTB17Q13105 803 aa18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 C9orf50Q5SZB4 431 aa18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 CES3Q6UWW8 571 aa18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 THEM5Q8N1Q8 247 aa18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 FERMT1Q9BQL6 677 aa18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 RRN3Q9NYV6 651 aa18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 IGSF9Q9P2J2 1179 aa18.58■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 SDR42E2A6NKP2 422 aa18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 COPEO14579 308 aa18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 NCALDP61601 193 aa18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 OVGP1Q12889 678 aa18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 STEAP4Q687X5 459 aa18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 EPAS1Q99814 870 aa18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 SLC13A1Q9BZW2 595 aa18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 VPS11Q9H270 941 aa18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 MANSC1Q9H8J5 431 aa18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 ECT2Q9H8V3 914 aa18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 KANSL3Q9P2N6 904 aa18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 NUDT5Q9UKK9 219 aa18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 PATJQ8NI35 1801 aa18.57■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 MSI1O43347 362 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 SRGAP2BP0DMP2 458 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 CD68P34810 354 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 GRIK1P39086 918 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 OR52K1Q8NGK4 314 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 C10orf82Q8WW14 230 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 YME1L1Q96TA2 773 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 SIK2Q9H0K1 926 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 NPHS2Q9NP85 383 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 SHROOM3Q8TF72 1996 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 NUP205Q92621 2012 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 HOXA2O43364 376 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 BAIAP3O94812 1187 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 IGLV3-25P01717 112 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 BGNP21810 368 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 BNIP1Q12981 228 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 CRYMQ14894 314 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 SLC39A12Q504Y0 691 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 LRRC43Q8N309 656 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 PLCD4Q9BRC7 762 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 CWH43Q9H720 699 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 PCMTD2Q9NV79 361 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 NEU3Q9UQ49 428 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 CHKBQ9Y259 395 aa18.56■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 TNFRSF10BO14763 440 aa18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 KRT38O76015 456 aa18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 ALDH1A2O94788 518 aa18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 GARSP41250 739 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 NIPAL4Q0D2K0 466 aa18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 GALNT2Q10471 571 aa18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 HDAC11Q96DB2 347 aa18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 MECRQ9BV79 373 aa18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 MYLK2Q9H1R3 596 aa18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 MARCH5Q9NX47 278 aa18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 PCDHB8Q9UN66 801 aa18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 CHD9Q3L8U1 2897 aa18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 GALTP07902 379 aa18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 PGAM1P18669 254 aa18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 TYMPP19971 482 aa18.55■□□□□ 0.56
USP18-201ENST00000215794 CCNFP41002 786 aa18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms