RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDK15Q96Q40 435 aa7.22□□□□□ -1.25
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 IRF6O14896 467 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FDX1P10109 184 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.2□□□□□ -1.26
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.17□□□□□ -1.26
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 SVOPQ8N4V2 548 aa7.15□□□□□ -1.26
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 GRM5P41594 1212 aa7.14□□□□□ -1.27
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADAMTS2O95450 1211 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.01□□□□□ -1.29
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDC14CA4D256 554 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ITGB2P05107 769 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAP3K10Q02779 954 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DCAF5Q96JK2 942 aa6.99□□□□□ -1.29
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