RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411249.1

RNU6-1199P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1199, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1199P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LYPD8Q6UX82 237 aa5.01□□□□□ -1.61
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RNU6-1199P-201ENST00000411249 RSPH6AQ9H0K4 717 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PLEKHG3A1L390 1219 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZNF511Q8NB15 262 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa5□□□□□ -1.61
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RNU6-1199P-201ENST00000411249 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
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RNU6-1199P-201ENST00000411249 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
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RNU6-1199P-201ENST00000411249 PTK2Q05397 1052 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
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RNU6-1199P-201ENST00000411249 PDXDC2PQ6P474 469 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CCDC116Q8IYX3 515 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1199P-201ENST00000411249 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PPP2R2DQ66LE6 453 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1199P-201ENST00000411249 IRF7Q92985 503 aa4.85□□□□□ -1.63
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