RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.71□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 AXIN1O15169 862 aa6.7□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 CTHP32929 405 aa6.7□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.7□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 ALDH1A1P00352 501 aa6.69□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF511Q8NB15 262 aa6.69□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 TSC1Q92574 1164 aa6.69□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.68□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.68□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.68□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 FOXJ1Q92949 421 aa6.67□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD3E-201ENST00000362899 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.63□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.63□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.62□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 BMP1P13497 986 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 NNTQ13423 1086 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 MPNDQ8N594 471 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 AGERQ15109 404 aa6.59□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.59□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.59□□□□□ -1.35
SNORD3E-201ENST00000362899 ARID5BQ14865 1188 aa6.58□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 NEUROD2Q15784 382 aa6.58□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.58□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.58□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 TRIM47Q96LD4 638 aa6.58□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 CDK15Q96Q40 435 aa6.58□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 AP1G2O75843 785 aa6.57□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 ADH1CP00326 375 aa6.57□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 NR3C2P08235 984 aa6.57□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 NR6A1Q15406 480 aa6.57□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.57□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.57□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 TIMP2P16035 220 aa6.56□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 GRM5P41594 1212 aa6.56□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.56□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 IL27Q8NEV9 243 aa6.56□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.55□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 NBPF14Q5TI25 921 aa6.55□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.55□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 RFC5P40937 340 aa6.54□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.54□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 LCE2CQ5TA81 110 aa6.54□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 TREML4Q6UXN2 200 aa6.54□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.54□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 SENP2Q9HC62 589 aa6.54□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 USP17L8P0C7I0 530 aa6.53□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 ERFEQ4G0M1 354 aa6.53□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 ITPKCQ96DU7 683 aa6.53□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 ZFP42Q96MM3 310 aa6.53□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.53□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.53□□□□□ -1.36
SNORD3E-201ENST00000362899 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 FSHRP23945 695 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 KIFC2Q96AC6 838 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 NR5A1Q13285 461 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 WFS1O76024 890 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 GOPCQ9HD26 462 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 SOBPA7XYQ1 873 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
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